参与连翘苯丙烷合成途径的WRKY转录因子的筛选与鉴定 |
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引用本文: | 张佳琪,刘晓冉,陈佳茜,郭广洋,谭新杰,赵杏利,胥华伟,刘浩,侯典云.参与连翘苯丙烷合成途径的WRKY转录因子的筛选与鉴定[J].中草药,2023,54(18):6055-6064. |
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作者姓名: | 张佳琪 刘晓冉 陈佳茜 郭广洋 谭新杰 赵杏利 胥华伟 刘浩 侯典云 |
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作者单位: | 河南科技大学农学院, 河南 洛阳 471023;洛阳市道地药材繁育与创新利用工程技术研究中心, 河南 洛阳 471023 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(U1404829);中央本级重大增减支项目“名贵中药资源可持续利用能力建设项目”(2060302);河南省自然科学基金项目(202102110156);河南省中药材产业科技特派员服务团、河南省中药产业技术体系建设专项资金资助 |
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摘 要: | 目的 筛选出参与连翘Forsythia suspensa苯丙烷合成途径的WRKY转录因子并进行生物信息学分析。方法 通过对从连翘转录组数据中筛选出的62条连翘WRKY基因序列进行鉴定;通过采用蛋白理化性质和基序分析、蛋白结构分析、系统进化分析、功能注释、蛋白互作分析、外源激素处理后实时荧光定量分析等方式进行相关分析。结果 最终筛选出52条具有WRKY结构域的连翘WRKY转录因子。WRKY转录因子编码蛋白的氨基酸数目在105~728,相对分子质量在12277.95~80 321.99。蛋白基序分析显示其均有WRKY结构域,与拟南芥WRKY转录因子构建系统进化树将连翘52个WRKY转录因子进一步分为3大类;筛选出5个可能参与连翘苯丙烷合成途径的连翘WRKY转录因子,并推测其可能以被MAPK级联反应所调控的方式介导连翘中苯丙烷合成途径。结论 通过分析转录组测序结果,从52个连翘WRKY转录因子中筛选出5个可能参与连翘苯丙烷合成途径的转录因子,其表现出组织特异性表达,且对不同浓度茉莉酸甲脂表现出不同的响应,为进一步研究其作用机制提供研究方向。
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关 键 词: | 连翘 次生代谢产物 WRKY 转录因子 苯丙烷合成途径 |
收稿时间: | 2023/2/3 0:00:00 |
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