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PCR测序和基因芯片快速鉴定分枝杆菌菌种的应用研究
引用本文:王峰,朱玉梅,桂静,蓝雅玲.PCR测序和基因芯片快速鉴定分枝杆菌菌种的应用研究[J].中国防痨通讯,2011,33(11):713-717.
作者姓名:王峰  朱玉梅  桂静  蓝雅玲
作者单位:518020.深圳市慢性病防治中心病原检验科
基金项目:“十一五”国家重大科技专项
摘    要:目的 评价2种分枝杆菌菌种快速鉴定方法的临床应用价值。方法 分别用16S~23S rDNA转录间隔序列(ITS)PCR-直接测序和基于16S rRNA基因的基因芯片检测21株分枝杆菌标准菌株和50株临床分离株。结果 21株分枝杆菌标准株中,ITS PCR测序法将18株准确鉴定到种,结核分枝杆菌、非洲分枝杆菌菌株只能鉴定到结核分枝杆菌复合群,海分枝杆菌无法鉴别是海分枝杆菌还是溃疡分枝杆菌;芯片法正确鉴定16株,1株胃分枝杆菌鉴定为堪萨斯分枝杆菌,3株不在芯片检测范围内。50株临床菌株中, 47株2种方法结果一致,1株不在芯片检测范围内。结论 基因芯片鉴定分枝杆菌快速、特异,准确性高,临床常规开展应用需要进一步研究。

关 键 词:分枝杆菌属  聚合酶链反应  寡核苷酸序列分析  
收稿时间:2011-03-16

Comparison of PCR sequencing and DNA microarray for rapid identification of mycobacterium species
WANG Feng,ZHU Yu-mei,GUI Jing,LAN Ya-ling.Comparison of PCR sequencing and DNA microarray for rapid identification of mycobacterium species[J].The Journal of The Chinese Antituberculosis Association,2011,33(11):713-717.
Authors:WANG Feng  ZHU Yu-mei  GUI Jing  LAN Ya-ling
Institution:Department of Pathogenic Laboratory, Shenzhen Center for Chronic Disease Control, Shenzhen 518020, China
Abstract:
Keywords:Mycobacterium  Polymerase chain reaction  Oligonucleotide array sequence analysis  
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