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应用16 S rDNA基因芯片检测4种产黑色素感染根管可疑致病菌
引用本文:江禾,曹慧敏,唐子圣,朱彩莲,梁景平,赵建龙,王友群,刘正.应用16 S rDNA基因芯片检测4种产黑色素感染根管可疑致病菌[J].临床口腔医学杂志,2007,23(11):655-658.
作者姓名:江禾  曹慧敏  唐子圣  朱彩莲  梁景平  赵建龙  王友群  刘正
作者单位:1. 中国药科大学药学院,江苏,南京,210009;中国科学院上海微系统与信息技术研究所生物芯片实验室
2. 中国科学院上海微系统与信息技术研究所生物芯片实验室
3. 上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院牙体牙髓科
4. 上海市口腔医学研究所
5. 中国药科大学药学院,江苏,南京,210009
基金项目:国家自然科学基金,上海市教委资助项目
摘    要:目的:研制快速检测牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)、牙髓卟啉单胞菌(Porphyromonas endodontalis,Pe)、中间普氏菌(Prevotella intermedia,Pi)和变黑普氏菌(Prevotella nigrescens,Pn)的芯片系统.方法:利用Genebank中细菌16 S rDNA保守区序列,设计一对通用引物;通过已知Pg、Pe、Pi和Pn的16 S rDNA可变区序列,设计合成对应的特异性寡核苷酸探针.先用通用引物PCR扩增所有标准菌株的DNA并作荧光标记,PCR产物和已点样有Pg、Pe、Pi和Pn4种探针的芯片杂交,并用荧光扫描仪进行分析.结果:芯片上的Pg、Pe、Pi和Pn 4种探针只与相对应的Pg、Pe、Pi和Pn的PCR产物反应,而与其他标准菌株的PCR产物无反应.结论:应用16S rDNA基因芯片可以准确检测Pg、Pe、Pi和Pn,快速、灵敏、特异性高,有望在临床上得到应用.

关 键 词:微阵列芯片  根管致病菌
文章编号:1003-1634(2007)11-0655-04
修稿时间:2007-10-02

Detection of Porphyromonas gingivalis Pg, Porphyromonas endodontalis Pe, Prevotella intermedia Pi, Prevotella nigrescens Pn by 16 S rDNA microarray chip
JIANG He,CAO Hui-min,TANG Zi-sheng,ZHU Cai-lian,LIANG Jing-Ping,ZHAO Jian-long,WANG You-qun,LIU Zheng.Detection of Porphyromonas gingivalis Pg, Porphyromonas endodontalis Pe, Prevotella intermedia Pi, Prevotella nigrescens Pn by 16 S rDNA microarray chip[J].Journal of Clinical Stomatology,2007,23(11):655-658.
Authors:JIANG He  CAO Hui-min  TANG Zi-sheng  ZHU Cai-lian  LIANG Jing-Ping  ZHAO Jian-long  WANG You-qun  LIU Zheng
Institution:LIU Zheng School of Pharmacy, China Pharmaceutical University. Nanjing 210009, China
Abstract:
Keywords:16 S rDNA
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