| 基于三维脑基因表达图谱的基因挖掘方法研究 |
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| 引用本文： | 刘蔷,李海云.基于三维脑基因表达图谱的基因挖掘方法研究[J].医疗设备信息,2008,23(5):8-11,31. |
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| 作者姓名： | 刘蔷 李海云 |
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| 作者单位： | 首都医科大学生物医学工程学院 硕士研究生北京100069(刘蔷)，首都医科大学生物医学工程学院 博士、教授、博导北京100069(李海云) |
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| 基金项目： | 北京市属市管高等学校人才强教计划资助项目(2005PHK). |
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| 摘 要： | 目的为了研究帕金森氏病发病机理,探索从多元三维脑基因表达图谱的基因芯片数据中提取帕金森氏病的基因的方法。方法用一种统计学方法对小鼠基因芯片数据进行初步筛选及标准化,将实验数据分成两个集合,计算基因表达数据的标准差并按升序排列,选出排名最靠前的数个基因(本实验选取基因总数的10%),并对其进行评估。结果选出的这18个基因为更好的研究帕金森氏病发病机理提供了一个思路,且该基因挖掘方法也适合其他疾病机理的研究。
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| 关 键 词： | 帕金森氏病 基因挖掘 基因芯片 |
| 文章编号： | 1674-1633(2008)05-0008-04 |
Research on the Selection of PD Genes from Multiplex 3D Brain Gene Expression Mapping |
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| LIU Qiang,LI Hai-Yun.Research on the Selection of PD Genes from Multiplex 3D Brain Gene Expression Mapping[J].Information of Medical Equipment,2008,23(5):8-11,31. |
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| Authors: | LIU Qiang LI Hai-Yun |
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| Abstract: | Objective To research a method of selecting PD gene based on microarray dataset from multiplex 3D brain gene expression mapping in order to obtain the vivid insights into molecular pathogenesis of Parkinson disease(PD). Method To use a statistical method for pre-selecting genes and normalizing gene expression data, dividing data into two subsets and calculating the standard deviation (SD) of gene expression; to use order statistics and binomial distribution, choosing the first 10% of genes with lowest SD and to evaluate the chosen genes in terms of a bioinformatics analysis. Result Comparing with the available methods, the new one just is of the efficient and accurate selection of genes with 18 PD genes extracted. |
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| Keywords: | Parkinson disease gene extraction gene dataset |
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