激光捕获显微切割和基因芯片技术用于肿瘤实质细胞转录组的构建 |
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引用本文: | 孙昱皓,樊军卫,裘国强,周崇治,彭志海. 激光捕获显微切割和基因芯片技术用于肿瘤实质细胞转录组的构建[J]. 肿瘤, 2008, 28(9). DOI: 10.3781/j.issn.1000-7431.2008.09.020 |
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作者姓名: | 孙昱皓 樊军卫 裘国强 周崇治 彭志海 |
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作者单位: | 上海交通大学附属第一人民医院普外科,上海,200080 |
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摘 要: | 目的:联合应用激光捕获显微切割和基因芯片技术构建纯化肿瘤实质细胞转录组。方法:应用激光捕获显微切割技术从肿瘤组织冰冻切片中获取纯化肿瘤实质细胞,提取RNA并对其进行线性扩增得到aRNA,合成cRNA探针后与全基因组基因芯片Affymetrix HG—U133.Plus 2.0 Gene—Chip杂交构建全基因组表达谱。结果:从5例结肠癌组织样本中各获取了3mm。细胞,抽提获得RNA118.4~300.3ng,混合后取100ng进行线性扩增获得aRNA 7ug。基因芯片各项质控标准符合基因表达谱芯片操作指南,共有18205条转录本表达,代表15276个基因。结论:联合应用激光捕获显微切割和全基因组基因芯片技术可构建纯化肿瘤实质细胞转录组。
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关 键 词: | 结肠肿瘤 激光 显微切割 分子探针技术 |
Construction of transcriptome profiling of cancerous parenchyma cells using laser capture microdisscction and Gene-Chip technology |
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