| 抗胃癌单链抗体可变区序列分析及空间结构模拟 |
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| 作者姓名： | Li-Juan Yang 侯颖春 Yu-Jie Bai 药立波 Cheng-Zhi Su |
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| 作者单位： | 1. 陕西师范大学生命科学学院,陕西省,西安市,710062
2. 中国人民解放军第四军医大学生物化学与分子生物学教研室,陕西省西安市,710032 |
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| 摘 要： | 目的:考察抗人胃癌抗体可变区轻、重链序列,选择合适的连接肽构建单链抗体,并模拟其三级结构,预测单链抗体结构与功能关系.方法:利用获得的源自抗人胃癌噬菌体抗体库中筛选出的抗体可变区轻、重链序列,通过分析抗体轻重链可变区C-端、N-端结构特征,选择合适的连接肽,进而利用分子模拟原理构建单链抗体可变区的空间构象;经过力学优化、动力学模拟确定其稳定的三维结构:借助距离几何学、表观静电分布、溶液可及性表面积分析,对单链抗体的结构特征及理化性质进行理论分析.结果:成功获得的单链抗体稳定构象,除连接肽位置的1个氨基酸构象不合理之外,其他位置构象合适.轻链CDR1、CDR2以及重链CDR3溶液可及性表面积分布较强,而轻链CDR3、重链CDR1、CDR2分布较弱.重链CDR3区带有较强的负电性.结论:所构建的单链抗体三维空间结构具有较高的合理性和可靠性.
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| 关 键 词： | 胃癌 单链抗体 力学优化 动力学模拟 溶液可及性表面积 表观静电分布 |
| 收稿时间： | 2008-04-28 |
| 修稿时间： | 2008-05-21 |
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