茯苓基因组中MYB转录因子基因家族鉴定及表达分析

目的 从全基因组水平挖掘茯苓Poria cocos MYB转录因子基因家族成员，并分析其在菌丝、菌核等部位及茉莉酸甲酯（methyl jasmonate,MeJA）诱导后菌丝中的表达模式，以期发现与茯苓发育及次生代谢物生物合成调控相关的MYB转录因子。方法 基于茯苓基因组数据，通过序列比对及保守结构域分析挖掘MYB转录因子基因，利用ExPASy在线工具预测分析MYB蛋白质理化性质，利用MEGA7.0软件构建茯苓MYB蛋白进化树，利用MEME在线工具分析保守基序，利用Plant CARE进行启动子区顺式作用元件分析，通过MeJA诱导菌丝并采用qRT-PCR方法检测基因相对表达量。结果 在茯苓基因组中共鉴定到10个含有特征性保守结构域的MYB转录因子，其中4个属于1R类型，4个属于2R类型，2个属于4R类型。进化树及保守基序显示，相同进化枝的MYB蛋白所含基序类型相似。启动子区预测分析发现了多类激素及逆境响应顺式作用元件。基因表达谱分析显示有2个基因（PcMYB7和PcMYB8）在菌丝中的表达量高于菌核中的表达量，而PcMYB9则是在菌核中表达量相对较高。MeJA诱导后，有3个基因（PcM...