| 生物钟相关基因在原发性肝细胞癌中的表达及临床意义——基于TCGA数据集分析 |
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| 引用本文： | 赵作梁,吴奕隆,商天宇,林苏,朱月永.生物钟相关基因在原发性肝细胞癌中的表达及临床意义——基于TCGA数据集分析[J].重庆医科大学学报,2023,48(1):71-75. |
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| 作者姓名： | 赵作梁 吴奕隆 商天宇 林苏 朱月永 |
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| 作者单位： | 1. 福建医科大学附属第一医院肝病中心，福州 350005 |
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| 基金项目： | 卫生厅中青年骨干资助项目(2018-ZQN-54) |
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| 摘 要： | 目的：探究生物钟相关基因在原发性肝细胞癌（简称肝癌）中的表达及意义。方法：从美国癌症和肿瘤基因图谱数据库（The Cancer Genome Atlas,TCGA）中下载肝癌数据424例，包括374例肝癌患者样本及50例正常对照样本。运用DECenter软件对51个生物钟相关基因进行差异表达分析，比较生物钟基因在肝癌患者及正常样本之间的表达情况。运用DAVID在线工具分析差异基因的GO及KEGG功能富集通路，并通过STRING数据库构建差异基因之间蛋白质相互作用网络。了解生物钟基因肝癌发生发展过程中的主要作用。结果：在374例肝癌患者样本的51个生物钟相关基因中，有21个基因在肝癌样本中表达上调（P<0.05）,3个基因表达下调（P<0.05）。生物钟基因高表达样本主要富集于Wnt信号通路、Hedgehog信号通路及Hippo信号通路（P<0.001）。参与调节昼夜节律和细胞代谢的10个生物钟基因在蛋白质相互作用网络中相关性最为紧密（P<0.001）。GO分析差异基因集中作用于调节昼夜节律、细胞代谢过程、基因表达等通路（P<0.001）。结论：生物钟相关基...
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| 关 键 词： | 原发性肝细胞癌 生物钟基因 TCGA |
| 收稿时间： | 2019/10/20 0:00:00 |
Expression and clinical significance of circadian genes on primary hepatocellular carcinoma: an analysis study based on TCGA database |
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| Zhao Zuoliang,Wu Yilong,Shang Tianyu,Lin Su,Zhu Yueyong.Expression and clinical significance of circadian genes on primary hepatocellular carcinoma: an analysis study based on TCGA database[J].Journal of Chongqing Medical University,2023,48(1):71-75. |
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| Authors: | Zhao Zuoliang Wu Yilong Shang Tianyu Lin Su Zhu Yueyong |
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| Institution: | 1. Liver Research Center, The First Affiliated Hospital of Fujian Medical University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | primary hepatocellular carcinoma circadian gene The Cancer Genome Atlas |
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