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| 人ID4基因启动子及上游顺式表达调控元件的克隆及特征分析 | |
| 引用本文： | 黄玉,李薇,迟小华,刘丽宏,张峰,党艳辉,杨波,卢学春. 人ID4基因启动子及上游顺式表达调控元件的克隆及特征分析[J]. 解放军医学杂志, 2010, 35(2) |
| 作者姓名： | 黄玉 李薇 迟小华 刘丽宏 张峰 党艳辉 杨波 卢学春 |
| 作者单位： | 1. 吉林大学第一医院血液肿瘤中心,长春,130021 2. 解放军第二炮兵总医院药剂科,北京,100800 3. 中国科学院北京基因组研究所,北京,100029 4. 解放军总医院南楼血液科,北京,100853 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(30873086、30772597) |
| 摘 要： | 目的克隆人ID4基因启动子及上游顺式调控元件,并对其结构及调控元件的特征进行生物信息学分析。方法从NCBI人类基因组数据库中截取ID4基因转录起始位点上游5′侧翼区约2242bp及下游5′非翻译区212bp的基因组序列。利用TESS和Genomax等在线分析软件进行启动子及上游调控元件的特征分析。设计PCR引物,采用分段扩增法,获得长度分别为1811bp和650bp的两条产物片段,分别插入pGEM-T载体,转化至Top10感受态大肠埃希菌,筛选阳性克隆。先后应用KpnⅠ/NheⅠ、KpnⅠ/EcoRⅠ对获得的两个pGEM-T重组载体及pGL3Basic荧光素酶报告载体进行双酶切,T4DNA连接酶连接,转化至Top10感受态大肠埃希菌,筛选阳性克隆,最后测序鉴定。结果获得长度为2461bp的ID4基因启动子DNA序列,经测序证实与人类基因组序列一致。ID4基因具有Ⅱ型启动子特征,有2个非常显著的上游元件(TATA盒和GC盒),GC含量占总碱基含量的65.9%。在转录起始位点上游-1000bp与下游212bp之间分别存在多个可能具有正向和负向调控作用的顺式元件。结论成功克隆了人ID4基因启动子及其顺式调控元件,并... |
| 关 键 词： | ID4蛋白 人 转录启动子 人工基因融合 计算生物学 |
Cloning and analysis of characteristics of human ID4 gene promoter and its upstream cis-regulatory element |
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| HUANG Yu,LI Wei,CHI Xiao-hua,LIU Li-hong,ZHANG Feng,DANG Yan-hui,YANG Bo,LU Xue-chun. Cloning and analysis of characteristics of human ID4 gene promoter and its upstream cis-regulatory element[J]. Medical Journal of Chinese People's Liberation Army, 2010, 35(2) | |
| Authors: | HUANG Yu LI Wei CHI Xiao-hua LIU Li-hong ZHANG Feng DANG Yan-hui YANG Bo LU Xue-chun |
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| Keywords: | |
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