高通量测序分析胆囊结石患者microRNA表达谱差异

目的 探讨胆囊结石和非结石患者胆囊黏膜中mi RNA表达谱的差异。方法 选取30例胆结石患者(结石组)和30例胆囊息肉患者(非结石组)的胆囊黏膜组织,采用Illumina Hi Seq 2500高通量测序技术进行深度测序,比较2组的micro RNA表达差异。对差异表达的mi RNAs进行筛选与靶基因预测,并进行GO和KEGG功能显著性富集分析。荧光定量RT-PCR(q RT-PCR)对差异表达mi RNAs进行验证。结果 结石组和非结石组分别获得2 215 832和1 424 770条序列,平均长度22 nt。2组间显著差异表达的mi RNA共计17个,其中9个表达上调,8个表达下调。GO分析结果示靶基因富集于离子的结合和转运、载脂蛋白结合、钙离子通道激活、蛋白激酶活性等分子功能以及大分子的合成和代谢、类固醇激素生物合成和代谢等生物进程。KEGG通路富集分析示靶基因多集中于癌症相关通路,包括WNT、Hippo等信号通路。q RT-PCR结果示差异性mi RNA的表达趋势与测序结果相一致。结论差异表达的mi RNA可能在胆囊结石的形成中具有重要作用。

Analysis of differential microRNA expression in patient with gallbladder stones through high-throughput sequencing technologies