| 结核潜伏感染蛋白Rv1737cB细胞、CTL及Th表位预测与分析 |
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| 引用本文： | 白雪娟,赵亚静,梁艳,吴雪琼. 结核潜伏感染蛋白Rv1737cB细胞、CTL及Th表位预测与分析[J]. 实用临床医药杂志, 2015, 19(3): 5-9,43 |
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| 作者姓名： | 白雪娟 赵亚静 梁艳 吴雪琼 |
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| 作者单位： | 解放军第309医院全军结核病研究所全军结核病防治重点实验室/结核病诊疗新技术北京市重点实验室,北京,100091 |
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| 摘 要： | 目的利用生物信息学方法建立一套预测B细胞、CTL及Th细胞免疫功能多肽的方法,用于筛选新型结核病诊断抗原分子和候选疫苗抗原。方法采用DNAStar软件包中的Protean软件从α螺旋、β折叠及转角等二级结构的数量和分布、亲水性和表面可及性等方面预测分析该蛋白序列成为B细胞表位的可能性,预测CTL表位时,先采用Blast方法分析该序列与人类序列的同源性,然后综合应用SYFPEITHI超基序法、BIMAS量化基序法及Net CTL预测其CTL表位,应用RANKPEP及SYFPEITHI超基序法远程预测Th细胞表位,筛选表位集中、分值较高者作为候选多肽片段。结果 Protean软件预测结果表明Rv1737c蛋白序列亲水性和表面可及性都较弱,α转角、β折叠结构数目较多且分布广泛,而转角及卷曲结构较少,B细胞表位数目较少;Rv1737c蛋白的CTL及Th表位主要集中于第100位氨基酸之后,其中与HLA-A2表型相对的CTL表位,与HLA-DRB1*0401及HLA-DRB1*1501表型相对的Th表位较其他表型数目较多、分值较高。结论 Rv1737c蛋白可能不利于作为B细胞抗原,但其可能是一种较好的T细胞抗原,成为结核病诊断抗原分子和候选疫苗抗原。
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| 关 键 词： | 结核分枝杆菌 Rv1737c 表位预测 生物信息学 |
Epitope prediction and analysis of Rv1737c protein of mycobacterium tuberculosis dormant infection on B cell,CTL and Th cells cells n on |
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| BAI Xuejuan , ZHAO Yajing , LIANG Yang , WU Xueqiong. Epitope prediction and analysis of Rv1737c protein of mycobacterium tuberculosis dormant infection on B cell,CTL and Th cells cells n on[J]. Journal of Clinical Medicine in Practice, 2015, 19(3): 5-9,43 |
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| Authors: | BAI Xuejuan ZHAO Yajing LIANG Yang WU Xueqiong |
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| Affiliation: | BAI Xuejuan;ZHAO Yajing;LIANG Yang;WU Xueqiong;Institute for Tuberculosis Research,Army Tuberculosis Prevention and Control Key Laboratory,Beijng Key Laboratory of New Techniques of Tuberculosis Diagnosis and Treatment,the 309th Hospital of People’s Liberation Army; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | mycobacterium tuberculosis Rv1737c epitopes prediction bioinformatics |
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