| 甘草中新NADPH细胞色素P450还原酶基因的克隆与相关生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 孙宇峰,厉妲,黄颖,杨晓涵,刘春生. 甘草中新NADPH细胞色素P450还原酶基因的克隆与相关生物信息学分析[J]. 中草药, 2019, 50(7): 1676-1681 |
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| 作者姓名： | 孙宇峰 厉妲 黄颖 杨晓涵 刘春生 |
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| 作者单位： | 北京中医药大学中药学院, 北京 102488,北京城市学院 生物医药学部, 北京 100094,北京中医药大学中药学院, 北京 102488,北京中医药大学中药学院, 北京 102488,北京中医药大学中药学院, 北京 102488 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（81773838） |
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| 摘 要： | 目的从甘草Glycyrrhiza uralensis中克隆1个新的NADPH细胞色素P450还原酶基因(Gu CPR,登录号:MH401048)并进行生物信息学分析。方法提取甘草根部总RNA后逆转录为cDNA,通过转录组数据库筛选得到Gu CPR基因全长,利用NCBI ORF finder得到其开放阅读框并翻译得氨基酸序列,设计引物进行PCR扩增,构建克隆重组质粒。利用生物信息分析预测蛋白性质、结构等及模拟蛋白三级结构,并构建同源系统进化树。结果克隆得到Gu CPR基因cDNA全长2 118bp,编码705个氨基酸残基,相对分子质量78 450,等电点(pI)5.19。Gu CPR蛋白为非分泌蛋白,不具有信号识别功能。跨膜预测结果显示蛋白的第44~64位氨基酸为跨膜区,同时,亚细胞定位预测结果显示蛋白位于内质网上。结论克隆得到一个新的Gu CPR,并进行了生物信息学分析,为进一步研究提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 甘草 NADPH细胞色素P450还原酶 基因克隆 生物信息学分析 PCR |
| 收稿时间： | 2018-09-09 |
Cloning and related bioinformatics analysis of new cytochrome NADPH P450 reductase gene in Glycyrrhiza uralensis |
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| SUN Yu-feng,LI D,HUANG Ying,YANG Xiao-han and LIU Chun-sheng. Cloning and related bioinformatics analysis of new cytochrome NADPH P450 reductase gene in Glycyrrhiza uralensis[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2019, 50(7): 1676-1681 |
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| Authors: | SUN Yu-feng LI D HUANG Ying YANG Xiao-han LIU Chun-sheng |
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| Affiliation: | College of Chinese Pharmacy, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Biology and Medicine, Beijing City University, Beijing 100094, China,College of Chinese Pharmacy, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,College of Chinese Pharmacy, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China and College of Chinese Pharmacy, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Glycyrrhiza uralensis Fisch. NADPH-cytochrome P450 reductase gene cloning bioinformatics analysis PCR |
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