| 丹参对视网膜色素变性病理过程Müller细胞特征性基因变化及关键蛋白表达的影响 |
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| 引用本文： | 宋厚盼,曾梅艳,彭俊,陈小娟,陈新怡,何卫波,杨毅敬,周亚莎,蔡雄,彭清华. 丹参对视网膜色素变性病理过程Müller细胞特征性基因变化及关键蛋白表达的影响[J]. 中草药, 2019, 50(8): 1863-1872 |
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| 作者姓名： | 宋厚盼 曾梅艳 彭俊 陈小娟 陈新怡 何卫波 杨毅敬 周亚莎 蔡雄 彭清华 |
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| 作者单位： | 湖南中医药大学中医诊断研究所, 湖南 长沙 410208;湖南中医药大学中医学院, 湖南 长沙 410208;湖南中医药大学 中医药防治眼耳鼻咽喉疾病湖南省重点实验室, 湖南 长沙 410208,湖南中医药大学中医学院, 湖南 长沙 410208,湖南中医药大学 中医药防治眼耳鼻咽喉疾病湖南省重点实验室, 湖南 长沙 410208;湖南中医药大学第一附属医院 眼科, 湖南 长沙 410007,湖南中医药大学中医诊断研究所, 湖南 长沙 410208;湖南中医药大学中医学院, 湖南 长沙 410208,湖南中医药大学中医诊断研究所, 湖南 长沙 410208;湖南中医药大学中医学院, 湖南 长沙 410208,湖南中医药大学中医诊断研究所, 湖南 长沙 410208;湖南中医药大学中医学院, 湖南 长沙 410208,湖南中医药大学 中医药防治眼耳鼻咽喉疾病湖南省重点实验室, 湖南 长沙 410208;湖南中医药大学第一附属医院 眼科, 湖南 长沙 410007,湖南中医药大学 中医药防治眼耳鼻咽喉疾病湖南省重点实验室, 湖南 长沙 410208,湖南中医药大学中医诊断研究所, 湖南 长沙 410208,湖南中医药大学中医诊断研究所, 湖南 长沙 410208;湖南中医药大学 中医药防治眼耳鼻咽喉疾病湖南省重点实验室, 湖南 长沙 410208;湖南中医药大学第一附属医院 眼科, 湖南 长沙 410007 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（81804150）；国家自然科学基金资助项目（81703920）；湖南省自然科学基金项目（2019JJ40226）；湖南省自然科学基金项目（2019JJ50442）；中医药防治五官科疾病湖南省重点实验室建设项目（2017TP1018）；湖南省中医药管理局科研项目（201780）；湖南省大学生研究性学习和创新性实验计划项目（2017280)；湖南省中医药科研计划重点项目（201901）；中医药防治眼耳鼻咽喉疾病湖南省重点实验室开放基金项目（2018YZD05）；湖南中医药大学中医学一流学科开放基金项目（2018ZYX26） |
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| 摘 要： | 目的基于网络药理学和生物信息学方法探讨丹参(SM)通过干预Müller细胞(MC)特征性基因和关键蛋白表达治疗视网膜色素变性(RP)的分子机制。方法运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索、筛选SM的入血活性成分和作用靶点;通过GEO数据库获取正常和RP小鼠MC差异表达基因;通过疾病数据库检索RP相关的基因靶点;采用Cytoscape构建MC差异表达基因和疾病靶点、成分靶点的蛋白质-蛋白质交互作用网络并提取交集;运用DAVID数据库对特征性基因进行基因本体和KEGG通路分析;采用cytoHubba分析筛选关键蛋白靶点。结果检索得到与SM相关的化学成分202个,依据ADME参数筛得活性成分65个,其中入血活性成分13个,进一步检索配对得到这些成分可能作用的靶点117个;从芯片数据中分析得到正常和RP小鼠MC中差异表达基因242个;从疾病数据库获得与RP密切相关的靶点206个;提取交集得到85个SM影响RP病理过程MC的特征性基因;这些基因主要涉及转录调控、凋亡信号通路调控、DNA核内复制调节等生物学过程,分子功能主要包括转录辅激活子活性、蛋白激酶活性、核心启动子结合等,富集于细胞核、核质、转录因子复合物、Rb-E2F复合体等区域,主要与剪接体信号通路、肌动蛋白细胞骨架调控信号途径、细胞周期调控通路等有关;分析筛选出SM干预RP病理过程MC中的8个关键蛋白靶点。结论 SM药效作用的物质基础为隐丹参酮、木犀草素、丹参酮ⅡA等13个化学成分;其所干预的RP病理过程MC特征性基因与剪接体信号通路、肌动蛋白细胞骨架调控信号途径、细胞周期调控通路等机制相关,关键靶点包括RB1、E2F1、TFDP1等8个蛋白。
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| 关 键 词： | 视网膜色素变性 Müller细胞 丹参 网络药理学 生物信息学 分子机制 |
| 收稿时间： | 2019-01-04 |
Effects of Salviae miltiorrhizae on characteristic gene changes and key protein expression of Müller cells in pathological process of retinitis pigmentosa |
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| SONG Hou-pan,ZENG Mei-yan,PENG Jun,CHEN Xiao-juan,CHEN Xin-yi,HE Wei-bo,YANG Yi-jing,ZHOU Ya-sh,CAI Xiong and PENG Qing-hua. Effects of Salviae miltiorrhizae on characteristic gene changes and key protein expression of Müller cells in pathological process of retinitis pigmentosa[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2019, 50(8): 1863-1872 |
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| Authors: | SONG Hou-pan ZENG Mei-yan PENG Jun CHEN Xiao-juan CHEN Xin-yi HE Wei-bo YANG Yi-jing ZHOU Ya-sh CAI Xiong PENG Qing-hua |
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| Affiliation: | Institute of Traditional Chinese Medicine Diagnostics, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China;College of Traditional Chinese Medicine, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China;Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine for Prevention and Treatment of Eye, Ear, Nose and Throat Diseases, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China,College of Traditional Chinese Medicine, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China,Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine for Prevention and Treatment of Eye, Ear, Nose and Throat Diseases, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China;Department of Ophthalmology, the First Affiliated Hospital of Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410007, China,Institute of Traditional Chinese Medicine Diagnostics, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China;College of Traditional Chinese Medicine, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China,Institute of Traditional Chinese Medicine Diagnostics, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China;College of Traditional Chinese Medicine, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China,Institute of Traditional Chinese Medicine Diagnostics, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China;College of Traditional Chinese Medicine, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China,Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine for Prevention and Treatment of Eye, Ear, Nose and Throat Diseases, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China;Department of Ophthalmology, the First Affiliated Hospital of Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410007, China,Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine for Prevention and Treatment of Eye, Ear, Nose and Throat Diseases, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China,Institute of Traditional Chinese Medicine Diagnostics, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China and Institute of Traditional Chinese Medicine Diagnostics, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China;Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine for Prevention and Treatment of Eye, Ear, Nose and Throat Diseases, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China;Department of Ophthalmology, the First Affiliated Hospital of Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410007, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | retinitis pigmentosa Müller cell Salviae miltiorrhizae Bge. network pharmacology bioinformatics molecular mechanism |
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