| 铁皮石斛赤霉素3-氧化酶基因的克隆及表达分析 |
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| 引用本文： | 刘思思,张岗,陈晓梅,李淑超,陈娟,郭顺星. 铁皮石斛赤霉素3-氧化酶基因的克隆及表达分析[J]. 中草药, 2016, 47(6): 990-996 |
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| 作者姓名： | 刘思思 张岗 陈晓梅 李淑超 陈娟 郭顺星 |
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| 作者单位： | 中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193 |
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| 基金项目： | 教育部博士点基金优先发展领域(20131106130002);药植所创新团队发展计划(PIRTI-IT1302);中央公益性科研院所基本科研业务费专项(YZ-12-14);中医药行业科研专项(201407005) |
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| 摘 要： | 目的克隆珍稀濒危药用植物铁皮石斛Dendrobium officinale赤霉素3-氧化酶(gibberellin 3-oxidases,GA3ox)基因(Do GA3ox),并进行生物信息学和表达分析。方法采用RACE和RT-PCR技术获得Do GA3ox基因c DNA全长;利用生物信息学软件预测其编码蛋白的理化性质、结构域及亚细胞定位等分子特性;用DNASTAR 7.0和MEGA 6.0软件分别对其进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测基因表达模式。结果克隆到Do GA3ox基因(Gen Bank注册号KT597694),c DNA全长1 318 bp,编码一条由353个氨基酸组成的多肽,相对分子质量为39 052.5,等电点6.21;Do GA3ox蛋白不含跨膜域和信号肽,具有GA3ox的保守结构域DIOX_N(40~130)和2OG-Fe II_Oxy(197~299);Do GA3ox与大葱、油棕、海枣、野茶树及蓝猪耳GA3ox蛋白一致性分别为55%、56%、54%、51%、50%,与单子叶植物大葱、油棕和海枣的亲缘关系较近。q RT-PCR实验结果显示Do GA3ox基因在铁皮石斛种子共生(非共生)萌发1~3级时,其相对表达量呈现出先升高后降低再升高的趋势,分别为未萌发种子的13.44(5.21)、7.28(2.32)和9.40(6.21)倍,由此可知,该基因在共生萌发种子中的表达量高于非共生萌发种子。结论首次克隆得到1个Do GA3ox基因的全长c DNA,其转录本在共生和非共生不同萌发级别种子中的表达特性说明该基因在铁皮石斛种子萌发中起着重要调控作用。
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 种子萌发 赤霉素3-氧化酶 克隆 实时荧光定量PCR |
| 收稿时间： | 2015-10-10 |
Cloning and expression analysis of gibberellin 3-oxidase gene in Dendrobium officinale |
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| LIU Si-si,ZHANG Gang,CHEN Xiao-mei,LI Shu-chao,CHEN Juan and GUO Shun-xing. Cloning and expression analysis of gibberellin 3-oxidase gene in Dendrobium officinale[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2016, 47(6): 990-996 |
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| Authors: | LIU Si-si ZHANG Gang CHEN Xiao-mei LI Shu-chao CHEN Juan GUO Shun-xing |
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| Affiliation: | Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrobium officinale Kimura et Migo seed germination GA3ox cloning real time quantitative PCR |
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