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1990~2004年上海市甲型流感病毒基因特性的研究
引用本文:李燕婷,陈健,孔立群,周妍,高烨,何懿,顾宝柯. 1990~2004年上海市甲型流感病毒基因特性的研究[J]. 疾病监测, 2006, 21(4): 178-182. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2006.4.178
作者姓名:李燕婷  陈健  孔立群  周妍  高烨  何懿  顾宝柯
作者单位:上海市疾病预防控制中心,上海,200336;上海市疾病预防控制中心,上海,200336;上海市疾病预防控制中心,上海,200336;上海市疾病预防控制中心,上海,200336;上海市疾病预防控制中心,上海,200336;上海市疾病预防控制中心,上海,200336;上海市疾病预防控制中心,上海,200336
摘    要:目的研究1990~2004年上海市甲型流感病毒流行株血凝素(HA)基因的特性,探讨流感病毒基因的变异与流感流行的关系。方法采用鸡胚和MDCK细胞两种方法分离甲型流感病毒。提取病毒RNA进行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增产物纯化,核苷酸序列测定,并用MegAlign软件进行基因种系发生树分析。结果2000年以来上海市流行的甲3亚型与A/Sydney/5/1997(H3N2),A/Wuhan/359/1995(H3N2)相比,HA1区的核苷酸同源性为95.7%~98.6%和96.8%~98.6%。与90年代流行甲3亚型同源性为88.4%~92.8%,氨基酸的替换发生在抗原决定簇A、B、E、D区和受体结合位点(RBS)的左臂。甲1亚型与A/HongKong/1131/1998(H1N1)、A/Shanghai/7/1999(H1N1)相比,核苷酸同源性为97.8%~99.3%,与90年代流行的甲1亚型同源性为96.8%~97.8%。基因种系发生树表明近几年甲型流感病毒与90年代流行株存在基因特性不同的分支。结论2000年以来上海市H1N1亚型的抗原性未发生明显的变异,H3N2亚型流感病毒的基因发生变异使抗原性发生漂移,是近年引起局部地流感暴发的主要因素。

关 键 词:流行性感冒病毒  甲型  血凝素基因  核苷酸序列
文章编号:1003-9961(2006)04-0178-04
收稿时间:2005-09-21
修稿时间:2006-03-09

Study on genetic characteristic of influenza A virus in Shanghai City between 1990 and 2004
LI Yan-ting,CHEN Jian,KONG Li-qun,ZHOU Yan,GAO Ye,HE Yi,GU Bao-ke. Study on genetic characteristic of influenza A virus in Shanghai City between 1990 and 2004[J]. Disease Surveillance, 2006, 21(4): 178-182. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2006.4.178
Authors:LI Yan-ting  CHEN Jian  KONG Li-qun  ZHOU Yan  GAO Ye  HE Yi  GU Bao-ke
Affiliation:1.Shanghai Municipal Center for Disease Control and Prevention;Shanghai 200336 China;
Abstract:
Keywords:influenza A virus  hemagglutimin(HA)gene  nucleotide sequence
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