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刚地弓形虫感染对小鼠脑组织转录本m6A甲基化修饰的影响
引用本文:解晓曼,孙航,代莉莎,朱文菊,王利磊,谢环环,董宏杰,张俊梅,王琦,周贝贝,赵桂华,徐超,尹昆.刚地弓形虫感染对小鼠脑组织转录本m6A甲基化修饰的影响[J].中国寄生虫学与寄生虫病杂志,2024(1):27-35+47.
作者姓名:解晓曼  孙航  代莉莎  朱文菊  王利磊  谢环环  董宏杰  张俊梅  王琦  周贝贝  赵桂华  徐超  尹昆
作者单位:山东省寄生虫病防治研究所,山东第一医科大学(山东省医学科学院)
基金项目:山东省自然科学基金(ZR2022MH197);;山东省医药卫生科技发展计划(202101050270)~~;
摘    要:目的 分析刚地弓形虫感染对小鼠脑组织转录本的N6-甲基腺苷(m6A)甲基化修饰水平的影响。方法 20只雌性C57BL/6J小鼠随机分为TgCtwh6感染组(7只)、LHG感染组(7只)和对照组(TgCtwh6感染组、LHG感染组的对照各3只)。TgCtwh6感染组、LHG感染组分别灌胃接种中国Ⅰ型wh6株(TgCtwh6)和中国Ⅲ型LHG株刚地弓形虫感染小鼠脑组织悬液0.2ml (20个包囊/鼠),对照组灌胃等量的生理盐水。分别在接种后15、30和45 d,用抽签法随机抽取感染组小鼠各1只,麻醉后处死,取脑组织,于显微镜下分别记录大脑皮层区、海马区和嗅球区的包囊数。感染后45 d每组分别取3只小鼠的全脑组织,提取总RNA,制备基因组文库,进行转录组测序,筛选差异甲基化位点(DML),统计感染组和对照组的mRNA的差异m6A甲基化位点及其所在转录本;对甲基化位点所在转录本进行基因本体功能注释(GO)分析,京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,对甲基化差异转录本进行基因集富集分析(GSEA)。选取甲基转移酶样3 (METTL3)、肥胖相关...

关 键 词:刚地弓形虫  m6A修饰  转录本  脑包囊  纳米孔三代测序
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