刺山柑治疗系统性硬化症机制的网络药理学探究及分子对接验证 |
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引用本文: | 郭嘉,卞华,单雨,赵晶晶,张潇文,陈爽,卞博.刺山柑治疗系统性硬化症机制的网络药理学探究及分子对接验证[J].海南医学院学报,2022(6):430-436. |
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作者姓名: | 郭嘉 卞华 单雨 赵晶晶 张潇文 陈爽 卞博 |
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作者单位: | 1. 河南中医药大学;2. 南阳理工学院张仲景国医国药学院河南省张仲景方药与免疫调节重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81774300); |
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摘 要: | 目的:基于网络药理学探究刺山柑治疗系统性硬化症(SSC)的分子机制。方法:使用GEO、GeneCards、PharmGkb、TTD以及DrugBank数据库获取SSC靶点,查阅相关文献及SwissTargetPrediction数据库获取刺山柑主要成分及其所对应靶点,取交集获取预测靶点。登录String数据库对预测靶点进行蛋白互作分析(PPI),进一步使用Cytoscape对网络拓扑分析获取核心基因,并将核心基因与刺山柑主要成分进行分子对接验证。使用R软件对预测靶点进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:共获取刺山柑有效成分15个及其靶点178个,SSC靶点3 171个,取交集得到预测靶点66个。拓扑分析得到PPI核心基因VEGFA、TNF、AKT1、PTGS2、MMP9等10个,GO分析涉及活性氧代谢过程、蛋白激酶B信号、炎症反应的调节、磷脂酰肌醇3-激酶信号等多项生物过程,KEGG通路分析得到PI3K-Akt信号通路、蛋白聚糖与癌症、黏着斑、Rap1信号通路等信号通路。结论:通过网络药理学方法预测刺山柑治疗SSC的分子机制,为刺山柑治疗SSC...
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关 键 词: | 刺山柑 系统性硬化症 网络药理学 分子对接 |
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