实时荧光PCR技术在HCV基因型检测中的应用 |
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引用本文: | 袁小珍;陈伟烈.实时荧光PCR技术在HCV基因型检测中的应用[J].广东医学,2011,32(5). |
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作者姓名: | 袁小珍;陈伟烈 |
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作者单位: | 广州市第八人民医院传染病研究所 |
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摘 要: | 目的 探讨实时荧光PCR技术在丙型肝炎病毒(HCV)基因型检测中的应用价值。方法 采用一步法逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)结合TaqMan技术,对HCV基因型进行实时荧光PCR检测;巢式RT-PCR扩增HCV的NS5B基因区域,测序后进行HCV基因亚型分析并与实时荧光PCR分型结果进行比较。结果 实时荧光PCR共分型119例,其中110例成功进行测序分型,实时荧光PCR分型的119例中1型71例,占59.7%,非1型48例,占40.3%;测序分型的110例中,1型73例(均为1b型),占66.4%,非1型37例(其中2a型7例、3a型6例、3b型3例、4a型1例、4k型1例、5a型1例、6a型17例、6n型1例),占33.6%。与110例测序分型的结果比较,实时荧光PCR分型总的符合率为71.8%(79/110),其中1型的符合率为80.8%(55/68),非1型的符合率为57.1%(24/42)。 结论 实时荧光PCR进行HCV基因型检测操作简便、快速,但分型结果特异性不高。
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