| 人头颈鳞癌中ceRNA网络构建及表达趋势 |
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| 引用本文： | 张岚,刘法昱.人头颈鳞癌中ceRNA网络构建及表达趋势[J].解剖科学进展,2020,26(2):143-145,149. |
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| 作者姓名： | 张岚 刘法昱 |
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| 作者单位： | 中国医科大学附属口腔医院院内感染管理办公室,辽宁沈阳110002;中国医科大学附属口腔医院口腔颌面外科,辽宁沈阳110002 |
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| 摘 要： | 目的分别比较4例HNSCC患者癌和癌旁组织的环状RNA、微小RNA和mRNA芯片表达谱,构建hsacircRNA103580/hsa-miR-9-5P/PRDM15相关的ceRNA网络,探讨其表达趋势。方法利用芯片筛选HNSCC组织中差异表达的circRNA、miRNA和mRNA基因,根据miRwalk3.0在线软件预测的结果,构建HNSCC中的circRNA/miRNA/mRNA-相关的ceRNA网络。采用qRT-PCR方法检测HNSCC组织中hsacircRNA103580/hsamiR-9-5P/PRDM15基因的表达。结果芯片技术检测4例HNSCC患者癌和癌旁组织中差异表达的circRNA、miRNA及mRNA基因,获得显著差异的环状RNAs转录本311个,microRNAs转录本52个及circRNA433个。结合以上数据,构建了一个包含48种circRNAs,21种miRNAs和79种mRNAs的ceRNA网络并验证has-circRNA103580、has-miR-9-5p与PRDM15的基因表达水平与芯片中表达趋势一致。结论hsacircRNA103580/hsa-miR-9-5P/PRDM15轴可能是HNSCC预后和治疗新的靶点。
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| 关 键 词： | 乳颈部鳞癌 生物信息学分析 ceRNA |
Construction and expression trend of ceRNA network in human head and neck squamous cell carcinoma |
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| ZHANG Lan,LIU Fa-yu.Construction and expression trend of ceRNA network in human head and neck squamous cell carcinoma[J].Progress of Anatomical Sciences,2020,26(2):143-145,149. |
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| Authors: | ZHANG Lan LIU Fa-yu |
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| Institution: | (Department of Oral and Maxillofacial Surgery,Shool&Hospital of Stomatology,China Medical University,Shenyang 110002,China;Hospital Infection Management Office,Shool&Hospital of Stomatology,China Medical University,Shenyang 110002,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | head and neck squamous cell carcinoma bioinformatic analyses ceRNA |
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