| 癌胚抗原低亲和力表位改造中的分子对接 |
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| 引用本文： | 支轶,吴玉章,万瑛,邹丽云,郭晟,刘娜.癌胚抗原低亲和力表位改造中的分子对接[J].免疫学杂志,2005,21(6):514-517. |
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| 作者姓名： | 支轶 吴玉章 万瑛 邹丽云 郭晟 刘娜 |
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| 作者单位： | 第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,400038;第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,400038;第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,400038;第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,400038;第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,400038;第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,400038 |
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| 基金项目： | 国家重大基础研究计划（2001CB510001）和国家自然科学基金（90208028,30490240）资助项目 |
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| 摘 要： | 目的通过分子对接方法筛选表位改造后的高亲和力CTL表位。方法在图形工作站上，将癌胚抗原来源的低亲和力表位及其N末端第一位残基以酪氨酸替换后的突变体，分别与MHCⅠ类分子进行对接，对接所得最佳构象进行600ps分子动力学模拟修正。结果改造后的突变体与MHC分子间存在较强的氢键和疏水相互作用，组成肽结合槽口袋A的残基Tyr7、Tyr171和Tyr159与多肽N末端形成稳定的氢键作用网络，并且P1位酪氨酸上的苯环可与Trp167上的苯环发生π-π堆积作用。结论分子对接模型预测的肽-MHC复合物作用模式，提示改造后的突变体与MHCⅠ类分子间具有更高的亲和力，与实验结果一致。
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| 关 键 词： | MHCⅠ类分子 CTL 表位 分子对接 分子动力学 |
| 文章编号： | 1000-8861（2005）06-0514-04 |
| 收稿时间： | 2005-09-15 |
| 修稿时间： | 2005-09-28 |
Molecular docking simulations of low-affinity CTL epitopes and its analogue derived from carcinoembryonic antigen |
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| ZHI Yi,WU Yu-Zhang,WAN Yin,ZOU Li-Yun,GUO Sheng,LIU Na.Molecular docking simulations of low-affinity CTL epitopes and its analogue derived from carcinoembryonic antigen[J].Immunological Journal,2005,21(6):514-517. |
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| Authors: | ZHI Yi WU Yu-Zhang WAN Yin ZOU Li-Yun GUO Sheng LIU Na |
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| Institution: | Institute of Immunology, PIA, Third Military Medical University, Chongqing 400038, China |
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