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虾脊兰属植物DNA条形码的确立
引用本文:任阳阳,张梦婷,张嘉丽,樊佳佳,张晓存,王俊,刘霞.虾脊兰属植物DNA条形码的确立[J].世界中医药,2016(11).
作者姓名:任阳阳  张梦婷  张嘉丽  樊佳佳  张晓存  王俊  刘霞
作者单位:1 武汉理工大学化学化工与生命科学学院,武汉,430070; 2 中国中医科学院中药研究所,北京,100700
基金项目:国家重大科技专项子课题“中药新药安全性检测技术与标准研究”——中药原料药混伪品分子基因鉴定技术与标准(编号:2014ZX09304-307-001-020)
摘    要:目的:结合ITS2、psb A-trn H和matk序列对兰科虾脊兰属植物进行物种区分鉴定研究,并确立能准确鉴别虾脊兰属植物的序列或者序列组合。方法:采用试剂盒法对已收集的6种虾脊兰属植物进行总DNA的提取,通过扩增及测序,运用codencode V4.2软件对所得序列进行拼接与剪切,使用MEGA5.0对ITS2、psb A-trn H和matk序列3种序列分别进行比对分析,计算种内及种间Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离,构建Neighbor-joining(NJ)系统聚类树。结果:实验共得到序列56条(包含Gen Bank序列17条),ITS2序列和mat K序列其种内最大遗传距离小于种间最小遗传距离,而该属psb Atrn H序列种内遗传距离范围和种间遗传距离范围有重合。结论:ITS2序列和mat K序列可以作为虾脊兰属部分植物的鉴定序列,而psb A-trn H序列不能用于虾脊兰属植物的鉴定。

关 键 词:DNA条形码  ITS2  psbA-trnH  matK  虾脊兰属
收稿时间:2016/3/31 0:00:00

Establishment of DNA barcode for the calanthe
Ren Yangyang,Zhang Mengting,Zhang Jiali,Fan Jiaji,Zhang Xiaocun,Wang Jun,Liu Xi.Establishment of DNA barcode for the calanthe[J].World Chinese Medicine,2016(11).
Authors:Ren Yangyang  Zhang Mengting  Zhang Jiali  Fan Jiaji  Zhang Xiaocun  Wang Jun  Liu Xi
Institution:1 School of Chemistry,Chemical Engineering and Life Sciences,Wuhan University of Technology,Wuhan 430070,China;2 China Academy of Chinese Medical Sciences,Institute of Chinese Materia Medica,Beijing 100700,China
Abstract:
Keywords:
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