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基于GEO数据库女性肺癌预后模型的构建和验证
作者姓名:王娟  欧阳锦  李淑隽  孙承操  黄邵鑫
作者单位:1. 武汉大学公共卫生学院;2. 南昌大学公共卫生学院;3. 武汉市职业病防治院;4. 九江学院基础医学院
基金项目:国家自然科学基金资助项目(编号:81802285);
摘    要:目的:开发出新的稳健的女性肺癌预后模型,为预测女性肺癌的生存情况及优化治疗策略提供依据。方法:从基因表达数据库(GEO)中下载并筛选出女性肺癌基因表达谱数据,建立训练集和验证集。在训练集中以3年生存时间为界限分组,运用Limma算法筛选差异表达基因(DEGs)。随后使用LASSO回归分析结合多元Cox回归分析确定关键预后基因,并构建风险评分模型,在验证集中验证其预测的准确性,最后结合临床指标建立生存预测列线图。结果:共筛选出160个DEGs,LASSO-Cox回归分析获得基因模型,分别为ADIRF、BMP2、BCHE、HMMR、TSPYL5、SCUBE2、ENPP5、MIR29B2和BEX5。风险评分结合临床指标建立了列线图,C指数为0.734,3年总体生存率的ROC曲线在训练集和验证集的曲线下面积(AUC)值分别为0.740(95%CI:0.674~0.806)和0.712(95%CI:0.569~0.854)。结论:基于GEO数据库构建的预后模型能有效预测女性肺癌的生存情况,有望为临床患者精准个性化的治疗决策提供帮助。

关 键 词:女性  肺癌  预后  差异表达基因  列线图
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