构建基于自噬相关lncRNAs皮肤黑色素瘤预后模型 |
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引用本文: | 刘洁,徐刚林,罗金菊,杨珺涵,李月,柳梦婷,杨珮珮.构建基于自噬相关lncRNAs皮肤黑色素瘤预后模型[J].武汉大学学报(医学版),2023(1):92-98. |
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作者姓名: | 刘洁 徐刚林 罗金菊 杨珺涵 李月 柳梦婷 杨珮珮 |
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作者单位: | 1. 荆门市第二人民医院/荆楚理工学院附属中心医院病理科;2. 荆门市第二人民医院/荆楚理工学院附属中心医院皮肤科 |
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摘 要: | 目的:构建预测皮肤黑色素瘤(SKCM)预后的自噬相关长链非编码RNA(lncRNAs)风险模型,寻找与SKCM预后相关的新的生物学标志物。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获得SKCM的lncRNAs的表达谱,以构建自噬基因与lncRNAs共表达网络。Lasso回归和多因素Cox回归寻找与自噬相关lncRNAs。根据自噬相关lncRNAs建立风险评分,并使用Cox回归检验其是否为独立的预后因素。利用GO和KEGG分析自噬相关lncRNAs的功能富集。结果:SKCM中鉴定出有11个自噬相关lncRNAs,其中7个(USP30-AS1、HCP5、WAC-AS1、EBLN3P、AL162171.1、LINC00339、THCAT158)是保护性因素,4个(LINC00518、AC009570.1、AC009495.2、LINC00665)是危险因素。根据风险评分Kaplan-Meier生存分析发现,高风险组SKCM预后明显差于低风险组,差异有统计学意义(P<0.001)。Cox回归提示风险评分(HR=1.333,95%CI:1.214~1.465,P<0.001)是影响S...
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关 键 词: | 皮肤黑色素瘤 自噬 lncRNA TCGA 预后 |
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