| 2a型丙型肝炎病毒5’非编码区的RACE护增及二级结构的分析 |
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| 引用本文： | 秦兆习,丛旭,等.2a型丙型肝炎病毒5’非编码区的RACE护增及二级结构的分析[J].中华实验和临床病毒学杂志,2002,16(4):333-336. |
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| 作者姓名： | 秦兆习 丛旭 |
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| 作者单位： | [1]东南大学医学院附属徐州医院肝炎科 [2]北京大学人民医院100044 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金 (3 9770 684，3 0 170 844 )，国家“十五”科技攻关计划资助 (2 0 0 1BA70 5B0 6) |
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| 摘 要： | 目的：获得真全长中国大陆2a型丙型肝炎病毒（HCV）5’非编码区（5’UTR）cDNA，并分析其一级结构和二级结构，为进一步研究其在HCR复制、翻译中的调控机制、开发新的抗HCV药物奠定基础。方法：利用逆转录套式聚合酶链反应（RT－PCR）联合限制性内切酶长度多态性分析（RFLP）初步筛选出1例2a型HCV感染者，采用cDNA末端快速扩增技术（RACE）扩增出一条约800bp的cDNA片段，A－T克隆，用RFLP与PCR鉴定重组子，全自动序列分析仪测定插入子序列，RNAdraw预测二级结构。结果：RACE法获得真全长2a型HCV 5’端序列。5个克隆中，3个克隆含全长5’UTR序列，与HCV－1，HC－C2，HC－J6，HC－J8相比，同源性分别为93．6％－94．4％，92．1％－93．0％，98．8％－99．7％，96．2％－96．5％，与2a型标准株HC－J6相比，21，170，222，247，339位不同，分别为G，A，C，C，T,但这些突变不影响其二级结构。另外2个克隆为5’端缺失突变株，分别缺失54bp和144bp。结论：RACE技术快速、有效、实用，可用效获得病毒基因组的末端序列；依此获得中国大陆2a型HCV的5’UTR cDNA；在感染者血液中存在5’端部分缺失的HCV基因片段。
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| 关 键 词： | 2a型丙型肝炎病毒 二级结构 丙型肝炎 5‘非编码区 序列分析 cDNA末端快速扩增技术 一级结构 |
| 修稿时间： | 2001年11月28 |
Amplification of hepatitis C virus 5' untranslated region gene by RACE and its secondary structure analysis] |
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| Zhaoxi Qin,Xu Cong,Dong Jiang,Minghao Ha,Hongsong Chen,Lai Wei.Amplification of hepatitis C virus 5'' untranslated region gene by RACE and its secondary structure analysis][J].Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology,2002,16(4):333-336. |
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| Authors: | Zhaoxi Qin Xu Cong Dong Jiang Minghao Ha Hongsong Chen Lai Wei |
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| Institution: | Institute of Hepatology, People's Hospital, Beijing University, Beijing 100044, China. |
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