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基因调控数据自动处理系统的设计及实现
引用本文:李石法,吴俊,夏小俊,翁建洪,孙啸. 基因调控数据自动处理系统的设计及实现[J]. 生物医学工程研究, 2005, 24(1): 1-3,7
作者姓名:李石法  吴俊  夏小俊  翁建洪  孙啸
作者单位:吴健雄实验室,东南大学,江苏,南京,210096
基金项目:863资助项目(2002AA231071);江苏省自然科学基金资助项目(BK2002057).
摘    要:随着人类基因组测序工作的完成,产生了大量的生物数据,这些数据以不同的形式分布在世界各地。为使基因调控和表达信息相关联,建立了基因调控信息集成数据库系统。由于数据来源分布广泛且数据格式不统一,影响了数据库的数据集成。此研究使用了网络智能代理的相关技术,自动下载Web数据,并且进行处理,从中提取出启动子、调控因子、结合位点等有效数据。本程序大大减轻了将网络数据集成到本地数据库的负担。

关 键 词:基因调控 启动子 模型匹配 自动处理
文章编号:1672-6278(2005)01-0001-03
收稿时间:2005-01-28
修稿时间:2005-01-28

The Design and Implement of the System for Automated Gene Data Processing
LI Shi-fa,WU Jun,XIA Xiao-jun,WENG Jian-hong,SUN Xiao. The Design and Implement of the System for Automated Gene Data Processing[J]. Journal Of Blomedical Englneerlng Research, 2005, 24(1): 1-3,7
Authors:LI Shi-fa  WU Jun  XIA Xiao-jun  WENG Jian-hong  SUN Xiao
Abstract:With the draft of the human genome has been completed, vast amount of life sciences data, which scattered around the world in the form of a variety of heterogeneous data sources, are generated. In order to co - relate the information of gene regulation and expression, an integrated database system of gene regulation information has been built. The data sources of the system are various and the data structures are disparate. So it brings difficulty in data integration. The technology of intelligent agent is applied to automated data downloading and processing. Then the interested data, such as promoter, factor, binding site ete, is extracted from the file. The program greatly reduces the work of the integration of web data.
Keywords:Gene regulation   Promoter   Pattern match   Automated processing
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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