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结肠腺瘤和结肠癌基因表达谱分析
引用本文:阴常欣,马文丽,朱秀兰,郑文岭.结肠腺瘤和结肠癌基因表达谱分析[J].山东医药,2008,48(40):25-27.
作者姓名:阴常欣  马文丽  朱秀兰  郑文岭
作者单位:1. 南方医科大学基因工程研究所,广东广州,510515
2. 南方医科大学基因工程研究所,广东广州,510515;华南基因组中心
基金项目:广东省生物芯片实验室建设项目  
摘    要:目的 研究结肠腺瘤、结肠癌基因表达谱,筛查结肠癌相关基因.方法 用BRB-Array Tools对公共基因芯片数据库GEO中的结肠腺瘤、结肠癌基因芯片表达数据进行统计学分析,找出在结肠腺瘤和结肠癌发生发展中均发生变化的基因及二者的特异性基因,进一步分析其功能.结果 样本聚类表明各类组织分类正确,比较后得到在腺瘤和腺癌中共同表达的104条基因,其中48条共同上调,56条共同下调;差异基因的功能涉及物质代谢、内环境稳态、细胞间通讯、细胞黏附、细胞增殖等多种肿瘤发生发展的重要生物学过程.结论 生物信息学方法发现的结肠腺瘤、结肠癌基因表达谱可为结肠癌的发病机制及治疗靶位的研究开辟新思路.

关 键 词:结肠腺瘤  结肠癌  基因表达谱  差异表达

Comparison of gene expression profile in colorectal adenoma and adenocarcinoma
YIN Chang-xin,MA Wen-li,ZHU Xiu-lan,ZHENG Wen-ling.Comparison of gene expression profile in colorectal adenoma and adenocarcinoma[J].Shandong Medical Journal,2008,48(40):25-27.
Authors:YIN Chang-xin  MA Wen-li  ZHU Xiu-lan  ZHENG Wen-ling
Institution:1 Institute of Genetic Engineering;South Medical University;Guangzhou 510515;P.R.China
Abstract:Objective To investigate the changes of gene expression in colorectal adenoma and adenocarcinoma.Method A dataset of gene expression profilings of colorectal adenoma,adenocarcinoma and normal mucosa was obtained from database GEO and analyzed by BRB-Array Tools.Genes commonly expressed in colorectal adenomas,carcinomas and differentially expressed in them specially were analyzed bioinformatically.Results The sample clusterings showed that most of the GeneChips were grouped perfectly.104 genes were selected ...
Keywords:colorectal adenoma  colorectal adenocarcinoma  gene expression profile  differential expression  
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