TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR联合检测难辨梭菌菌属基因及毒素基因方法学的建立

目的 建立一种简便、快速难辨梭菌菌属鉴定及其毒素基因筛查的荧光定量PCR检测方法。方法 采用TaqMan-MGB探针，通过real-time PCR分析系统，同时检测难辨梭菌菌属基因磷酸丙糖异构酶（Tpi）、A毒素（TcdA）、B毒素（TcdB）及缺失部分基因的A毒素（TcdAT），从特异度、灵敏度及其抗干扰性等方面评价该方法，并联合全自动酶联荧光免疫系统（VIDAS）检测50 例临床不明原因腹泻病例粪便标本探讨其应用价值。结果 难辨梭菌非产毒株 Tpi 基因（tpi）的检测下限是6×10^-2 CFU/μl，产毒株 tpi、tcdA、tcdB、tcdAT 的检测下限为 6×10^-1 CFU/μl；难辨梭菌非产毒株tpi检测下限批内、批间变异率分别为2.1%和2.3%；产毒株tpi、tcdA、tcdB、tcdAT的检测下限批内、批间变异率依次为3.0%和3.4%、2.9%和3.2%、5.3%和5.7%、2.7%和2.8%。临床常见分离菌株及梭菌属其他细菌对检测无干扰。50 例不明原因腹泻病例粪便标本中，采用TaqMan-MGB 探针实时荧光 PCR 与 VIDAS 酶标免疫检测 39 例阴性标本其符合率为 100%；6 例两方法检测均为阳性；3例VIDAS酶标免疫检测为可疑及2例为阴性，经TaqMan-MGB探针实时荧光PCR检测为A-/B＋菌株。结论 建立的TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR具有高通量、高灵敏度和重复性好的特性，且可筛查携带缺失部分基因的TcdA难辨梭菌菌株。

Using the real-time PCR assay to establish TaqMan-MGB probe for rapid identification of Clostridium difficile and its toxin