| 浙江省2002--20 1 0年急性出血性结膜炎暴发疫情病原体CA24v的全基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 李焕,徐昌平,严菊英,卢亦愚,金青青,冯燕,莫世华.浙江省2002--20 1 0年急性出血性结膜炎暴发疫情病原体CA24v的全基因组序列分析[J].中华流行病学杂志,2013,34(5):496-502. |
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| 作者姓名： | 李焕 徐昌平 严菊英 卢亦愚 金青青 冯燕 莫世华 |
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| 作者单位： | 宁波大学医学院流行病与卫生统计学专业, 315211;浙江省疾病预防控制中心病毒所浙江省公共卫生应急检测关键技术重点实验室;浙江省疾病预防控制中心病毒所浙江省公共卫生应急检测关键技术重点实验室;浙江省疾病预防控制中心病毒所浙江省公共卫生应急检测关键技术重点实验室;宁波大学医学院流行病与卫生统计学专业, 315211;浙江省疾病预防控制中心病毒所浙江省公共卫生应急检测关键技术重点实验室;浙江省疾病预防控制中心病毒所浙江省公共卫生应急检测关键技术重点实验室 |
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| 基金项目： | 浙江省公共卫生检验检测重点学科群(XKQ一009一003) |
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| 摘 要： | 目的 分析2002--2010年浙江省急性出血性结膜炎(AHC)暴发疫情病原柯萨奇病毒A组24型变种(CA24v)流行株的全基因组序列与遗传特性。方法 选取浙江省不同年份的CA24v流行株，采用RT-PCR扩增基因序列，并与国内外流行株进行全基因组及VPl、3C区序列比较分析。结果 浙江省2002年和2010年CA24v全序列为7456～7458 bp，编码含2214个氨基酸残基的多聚蛋白，2010年的Zhejiang／08／10较2002年的毒株在5’端非编码区的第97、119位各存在一个T碱基插入，Zhejiang／08／10与2002年以来的分离株各区段氨基酸同源性为94．7％～100．0％，与近60年来CA24流行代表株全序列中各区段氨基酸的平均差异率以2A区与3A区最大，分别达8．4％和7．3％。3D区最小，仅为1．9％。1987年与2002年以来的CA24v毒株在全序列上共存在38个和20个氨基酸的稳定变异。2002--2010年CA24v的组间遗传距离分析表明，3c区较VPl区更为稳定，CA24v的早年流行株Jamaica／10628／87在3D区上可能存在重组，而在近年流行株中未发现该现象。结论 CA24v以时间序列为主逐年进化，地域间虽存在差异，但影响较小。自2002年起，由CA24v引起的AHC一直在浙江省本地散在流行。
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| 关 键 词： | 急性出血性结膜炎 柯萨奇病毒A组24型变种 全基因组序列分析 重组 |
| 收稿时间： | 2012/11/29 0:00:00 |
Study on the complete sequence of CA24 variant isolated during the acute hemorrhagic conjunctivitis outbreaks in Zhejiang province during 2002 to 2010 |
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| LI Huan,XU Changping,YAN Juying,LU Yiyu,JIN Qingqing,FENG Yan and MO Shihua.Study on the complete sequence of CA24 variant isolated during the acute hemorrhagic conjunctivitis outbreaks in Zhejiang province during 2002 to 2010[J].Chinese Journal of Epidemiology,2013,34(5):496-502. |
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| Authors: | LI Huan XU Changping YAN Juying LU Yiyu JIN Qingqing FENG Yan and MO Shihua |
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| Institution: | Medical School of Ningbo University, Ningbo, 315211, China;Virus Institute of Zhejiang Provincial Centre for Disease Control and Prevention;Virus Institute of Zhejiang Provincial Centre for Disease Control and Prevention;Virus Institute of Zhejiang Provincial Centre for Disease Control and Prevention;Medical School of Ningbo University, Ningbo, 315211, China;Virus Institute of Zhejiang Provincial Centre for Disease Control and Prevention;Virus Institute of Zhejiang Provincial Centre for Disease Control and Prevention |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Acute hemorrhagic conjunctivitis Coxsackievirus A24 variant Complete genome sequence analysis Recombination |
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