miR-143-3p在胃癌组织中的表达和临床意义研究以及生信分析

目的探索miR-143-3p在胃癌细胞和胃癌组织中的表达、并分析其异常表达的临床意义;同时采用生物信息学方法,进行靶基因和信号通路富集分析。方法采用实时荧光定量PCR法检测miR-143-3p在正常胃黏膜细胞和5种胃癌细胞,以及胃癌组织和癌旁组织中的表达,并分析其临床意义。采用OncomiR和YM500数据库分析miR-143-3p在胃癌组织和癌旁组织中的表达。采用miRecords网站数据库的预测软件预测其靶基因,选择至少3个以上软件支持的靶基因,运用DAVID 6.7软件在线富集分析其靶基因参与的信号通路。结果实验结果表明:相对于正常胃黏膜上皮细胞GES-1,miR-143-3p在不同分化程度的胃癌细胞,包括SGC-7901(中分化)、MKN-45(中分化)、MGC-803(低分化)、BGC-823(低分化)和HGC-27(未分化)细胞中的表达量均明显下调(P<0.001)。实时荧光定量PCR检测结果表明:相对于癌旁组织,miR-143-3p在胃癌组织中的表达在36例中下调,在18例中上调,4例变化不明显。miR-143-3p在胃癌组织中的表达与胃癌淋巴结转移以及浸润深度相关(P<0.05)。生信分析结果显示,miR-143-3p的靶基因富集在38个与肿瘤相关的信号通路中。结论 miR-143-3p是胃癌中表达下调的分子标志物,是潜在的具有临床相关性的抑癌基因,可能参与胃癌发生发展过程中的生物学行为。

The expression and clinical significance of miR-143-3p in gastric cancer tissues with bioinformatical analysis

NIU Rong;WANG Zhuanxiong;BAI Yue;ZHAO Wentao;HU Yonghua;TIAN Yihong;LI Hailong(No.1 Department of Thoracic Surgery, Gansu Provincial Cancer Hospital, Lanzhou 730050, P. R. China;School of Clinical Medicine, Gansu University of Chinese Medicine, Lanzhou 730000, P. R. China)