| 深圳市新分离两株基孔肯雅热病毒的分子遗传学分析 |
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| 引用本文： | 许少坚,任燕,孙华杰,李贻汉,蔡剑辉,何小媚,白江涛,阳帆,王金明.深圳市新分离两株基孔肯雅热病毒的分子遗传学分析[J].中国热带医学,2015,15(5). |
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| 作者姓名： | 许少坚 任燕 孙华杰 李贻汉 蔡剑辉 何小媚 白江涛 阳帆 王金明 |
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| 作者单位： | 1. 深圳市龙华新区疾病预防控制中心,广东深圳,518109
2. 深圳市疾病预防控制中心,广东深圳,518055 |
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| 摘 要： | 目的 对2010～2012年深圳市报告的两起输入性基孔肯雅热病原体进行分子遗传学分析.方法 利用C6/36细胞从病人血清中分离基孔肯雅病毒(Chikungunya virus,CHIKV),对分离得到的CHIKV进行全基因组测序和构建系统发生树,结合流行病学资料对其分子遗传特征进行分析.结果 成功分离得到两株CHIKV,分别命名为SZ_20101028和SZ 20120702,SZ_20101028全基因组长为12377bp,SZ_20120823全基因组长为11893bp;构建系统发生树分析,结果表明,SZ_20101028是印度洋亚型,ECSA型的后裔.SZ_20120702为Asian亚型.结论 SZ_20101028与最近10年来在印度洋岛屿爆发流行新亚型且与2010年由输入性引发起东莞疫情爆发的毒株亲源性最高,为99％;而SZ_20120702为Asian亚型,不是近年来爆发流行株.
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| 关 键 词： | 基孔肯雅病毒 系统发生树 溯源分析 |
Molecular genetic analysis of two Chikungunya virus strains isolated in Shenzhen |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chikungunya virus Phylogenetic tree Traceability analysis |
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