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肾细胞癌相关诊断基因筛选及免疫浸润特性分析
作者姓名:白洋洋  郭依琳  陈瑞廷  潘世杰  孙继建
作者单位:1. 河南省中医院泌尿外科;2. 郑州大学第二附属医院妇产科
基金项目:河南省重点研发与推广专项(科技攻关)(222102310651);
摘    要:目的 探讨肾细胞癌(RCC)相关的诊断基因和免疫浸润特性。方法 从基因表达汇编(GEO)数据库中获取RCC相关基因的表达数据,筛选肿瘤组织和正常组织间差异表达基因,利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)及最小绝对收缩和选择算法(LASSO)Cox回归模型筛选RCC相关枢纽基因,通过基因表达量、受试者工作特征曲线及免疫组化验证所得枢纽基因的准确性,最后利用免疫细胞单样本基因富集分析肿瘤组织和正常组织间免疫细胞浸润相对丰度。结果 选取GSE11151和GSE66272作为训练集,筛选得到差异表达基因384个,其中上调基因129个,下调基因255个,主要富集于酪氨酸代谢、吞噬体、补体与凝血级联反应、醛固酮调节钠重吸收和PPAR信号通路,通过WGCNA及LASSO Cox回归模型二次筛选差异表达基因,得到关于RCC的诊断基因ASS1、DIO1、FAM151A、SLC6A19和SLC22A6。其中ASS1、FAM151A、SLC6A19和SLC22A6与RCC临床分期相关,SLC6A19与RCC预后相关。免疫细胞单样本基因富集分析显示,对比正常组织,T细胞、树突状细胞、髓系抑制性细胞、B细胞、...

关 键 词:肾细胞癌  诊断基因  基因共表达网络分析  免疫浸润
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