| 阳春砂实时荧光定量PCR内参基因的筛选 |
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| 引用本文： | 于安民,王焕,何雪莹,邓可,詹若挺,杨锦芬. 阳春砂实时荧光定量PCR内参基因的筛选[J]. 广州中医药大学学报, 2014, 0(5) |
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| 作者姓名： | 于安民 王焕 何雪莹 邓可 詹若挺 杨锦芬 |
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| 作者单位： | 广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心，广东广州 510006; 岭南中药资源教育部重点实验室 广州中医药大学，广东广州 510006 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目 |
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| 摘 要： | 【目的】筛选稳定表达的内参基因,用于阳春砂不同发育时期的果皮和种子团中基因表达量实时荧光定量PCR(qRTPCR)检测的校正。【方法】以阳春砂3个不同发育时期的果实(分为果皮和种子团)为材料,根据高通量测序得到的转录组和表达谱数据,选择5个表达稳定的常用内参基因β-actin、EF-1α、GAPDH、PGK和TUA作为候选基因,并利用qPCR技术检测它们在不同样品中表达水平的变化,使用GeNorm和NormFinder软件对基因的稳定性进行分析。【结果】5个内参基因在不同发育时期的果皮和种子团中的表达稳定性有明显的差异,其中GeNorm分析得到的内参基因的稳定顺序为:EF-1α=TUAPGKGAPDHβ-actin,NormFinder的分析结果中稳定性最好的是EF-1α,其次为TUA,其他3个内参基因稳定性的排列顺序与GeNorm软件的结果一致。【结论】可选用EF-1α和TUA作为阳春砂果实发育过程中基因表达量差异分析的双内参基因。
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| 关 键 词： | 阳春砂 荧光定量PCR 内参基因 基因表达 果实 |
Screening of Reference Genes for Real-time Fluorescence Quantitative PCR in Amomum villosum Lour |
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| YU Anmin,WANG Huan,HE Xueying,DENG Ke,ZHAN Ruoting,YANG Jinfen. Screening of Reference Genes for Real-time Fluorescence Quantitative PCR in Amomum villosum Lour[J]. Journal of Guangzhou University of Traditional Chinese Medicine, 2014, 0(5) |
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| Authors: | YU Anmin WANG Huan HE Xueying DENG Ke ZHAN Ruoting YANG Jinfen |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Amomum villousm Lour. Fluorescence quantitative PCR Reference genes Gene expression Fruits |
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