| 基于小波多尺度的人类胚胎期大脑皮层基因表达分析 |
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| 引用本文： | 罗万春,陈军,伍亚舟,张彦琦,易东. 基于小波多尺度的人类胚胎期大脑皮层基因表达分析[J]. 重庆医学, 2009, 38(12) |
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| 作者姓名： | 罗万春 陈军 伍亚舟 张彦琦 易东 |
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| 作者单位： | 数学教研室卫生统计学教研室,重庆,400038;卫生统计学教研室,重庆,400038 |
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| 摘 要： | 目的 去除人类胚胎期大脑皮层基因表达信号噪声.方法 将10 080个基因原始表达数据预处理后采用小波多尺度去除噪声.选用常用小波函数db1(sym1,Haar)、db2(sym2)、db3(sym3)、db4、db5、db6、db7、db8、dbd9、db10、bior1.3、bior2.4、sym4、sym5作多尺度分析,并按照频率分解为5层.结果 分为5个尺度时小波函数db3去噪效果最好. 结论多尺度分析用于大脑皮层基因表达去除噪声,能尽可能多地保留基因表达有用信息.
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| 关 键 词： | 基因表达 大脑皮层 多尺度分析 |
Analysis of gene expression data of human embryo cerebral cortex based on multicale |
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| LUO Wan-chun,,CHEN Jun,WU Ya-zhou,et al.. Analysis of gene expression data of human embryo cerebral cortex based on multicale[J]. Chongqing Medical Journal, 2009, 38(12) |
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| Authors: | LUO Wan-chun CHEN Jun WU Ya-zhou et al. |
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| Affiliation: | LUO Wan-chun1,2,CHEN Jun2,WU Ya-zhou2,et al.(1.Department of Mathematics,2.Department of Medical Statistics,Third Military Medical University,Chongqing 400038,China) |
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| Abstract: | Objective To denoise the gene expression signals of embryo cerebral cortex.Methods After pretreating the primal data of 10 080 genes,we used wavelet mutiscale to denoise.Results db3 was the best wavelet function to denoise the gene expression signals,when the signals were decomposed into five scales.Conclusion Multiscale ananysis can be used to denoise the gene expression signals of embryo cerebral cortex,which can reserve more useful information of the genes expression. |
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| Keywords: | gene expression cerebral cortex multiscale analysis |
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