2012年江苏地区12家医院细菌耐药监测评价 |
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引用本文: | 黄梅,梅亚宁,李岷,张之烽,夏永祥,朱小平,邓丽华,褚少朋,张险峰,茆海丰,阴晴,王玉明,邵海枫.2012年江苏地区12家医院细菌耐药监测评价[J].临床检验杂志,2013,31(10):731-735. |
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作者姓名: | 黄梅 梅亚宁 李岷 张之烽 夏永祥 朱小平 邓丽华 褚少朋 张险峰 茆海丰 阴晴 王玉明 邵海枫 |
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作者单位: | 无锡新区虎马生物信息工作室,江苏无锡 214026/无锡市克隆遗传技术研究所,江苏无锡 214026 |
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摘 要: | 摘要:生物信息学(bioinformatics)是基于分子生物学理论,并与生物学、数学、计算机科学、信息学融合而成的交叉复合学科。收集、整理、解析生物学实验数据是生物信息学的主要任务。本文扼要介绍了该技术在与细菌耐药相关基因分析中的应用。包括可将测得序列与数据库比对,测得的变异基因序列翻译成氨基酸序列委托Swiss Model Workspace作三维结构同源建模,进行可视化分析与分子对接分析。将测序所得细菌全基因组序列上传至基因自动注释网站,可获得编码基因序列和相应的蛋白质序列;上传至日本京都基因和基因组百科全书(KEGG)在线注释工具KAAS,可获得细菌代谢途径示意图。利用基因组数据库也可进行全基因组数据分析。
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关 键 词: | 生物信息学 细菌 耐药机制 |
收稿时间: | 2013/7/24 0:00:00 |
Monitoring and assessment on antimicrobial resistance of bacteria in 12 hospitals of Jiangsu province, China, 2012 |
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Abstract: | |
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Keywords: | antimicrobial resistance of bacteria Jiangsu province hospital |
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