| 基于LASSO回归筛选影响肺腺癌患者预后的糖酵解相关基因 |
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| 引用本文： | 杜也,米热阿依·阿布都热孜克,左冉,袁东琪,霍庚崴,陈金良,张翠翠,孟昭婷,陈鹏. 基于LASSO回归筛选影响肺腺癌患者预后的糖酵解相关基因[J]. 中国肿瘤临床, 2023, 50(1): 16-21. DOI: 10.12354/j.issn.1000-8179.2023.20220189 |
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| 作者姓名： | 杜也 米热阿依·阿布都热孜克 左冉 袁东琪 霍庚崴 陈金良 张翠翠 孟昭婷 陈鹏 |
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| 作者单位： | 天津医科大学肿瘤医院肺部肿瘤内科，国家恶性肿瘤临床医学研究中心，天津市肿瘤防治重点实验室，天津市恶性肿瘤临床医学研究中心，天津市肺癌诊治中心（天津市300060） |
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| 基金项目： | 本文课题受天津市科学技术委员会重大项目（编号:18ZXDBSY00050）资助 |
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| 摘 要： | 目的 确定用于评估肺腺癌（lung adenocarcinoma，LUAD）患者糖酵解相关基因的风险评分模型。 方法 使用公共数据库癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas，TCGA）中LUAD患者转录组数据，通过基因富集分析（gene set enrichment analysis，GSEA）、差异表达基因（differentially expressed genes，DEGs）分析和最小绝对收缩选择算子（least absolute shrinkage and selection operator，LASSO）回归分析构建风险预测模型。通过Kaplan-Meier分析、受试者工作特征（receiver operating characteristic，ROC）曲线、单因素及多因素Cox回归分析验证模型预测性能。使用CIBERSORT算法计算高、低风险两组免疫细胞浸润差异。构建用于临床预测患者预后的列线图。 结果 识别出3个糖酵解相关基因集，筛选出6个糖酵解相关基因构建风险评分模型。高风险组总生存率显著低于低风险组，验证性结果显示该模型有良好的预测性能。高、低风险两组的免疫细胞浸润情况存在显著差异。列线图的构建开发了一种可以预测LUAD患者生存率的定量方法。 结论 基于糖酵解相关基因构建的风险评分模型为早期LUAD患者预测预后提供了新型生物标志物。
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| 关 键 词： | 肺腺癌 风险评分模型 糖酵解 预后 |
| 收稿时间： | 2022-06-08 |
Screening of glycolysis-related genes affecting prognosis of patients with lung adenocarcinoma based on LASSO regression |
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| Affiliation: | Department of Thoracic Oncology, Tianjin Medical University Cancer Institute & Hospital, National Clinical Research Center for Cancer, Tianjin Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin's Clinical Research Center for Cancer, Tianjin Lung Cancer Center, Tianjin 300060, China |
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