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肠道细菌基因间重复序列基因分型方法研究副溶血性弧菌的基因多态性
引用本文:宋启发,徐景野,朱国良,沈玄艺,章丹阳. 肠道细菌基因间重复序列基因分型方法研究副溶血性弧菌的基因多态性[J]. 中华微生物学和免疫学杂志, 2012, 32(1)
作者姓名:宋启发  徐景野  朱国良  沈玄艺  章丹阳
作者单位:315010, 宁波市疾病预防控制中心微生物检验科
基金项目:宁波市农业社会发展项目资助
摘    要:目的 采用肠道细菌基因间重复序列(enterobacterial repetitive intergenic consensus,ERIC)基因分型技术对副溶血性弧菌进行分型,评估其基因多态性,探讨其在鉴别该菌散发和暴发中的应用.方法 采用ERIC-PCR分型方法对187例分离自患者、海产品和环境中的副溶血性弧菌基因组模板进行扩增,根据PCR产物中不同产物片段组合模式获得基因型,采用进化树分析软件直观评价不同基因型的相似性,并根据离散程度分为不同的族,同时进行血清分型.结果 187例菌株可获得产物长度160~2780 bp共16种大小不同的PCR产物片段,所有菌株根据扩增片段分布可分为59种基因指纹模式,通过进化树软件可分为12族,血清分型结果表明O3∶K6为86% (161/187),O2、O4和O12占4% (8/187),10% (18/187)无法分型.结论 ERIC-PCR分型结果表明,我国分离的副溶血性弧菌具有较高基因多态性,ERIC-PCR具有高分辨力,可用于快速基因分型.

关 键 词:副溶血性弧菌  细菌分型技术  肠道细菌基因间重复序列

Study of gene polymorphism of Vibrio parahaemolyticus based on enterobacterial repetitive intergenic consensus sequences
SONG Qi-fa , XU Jing-ye , ZHU Guo-liang , SHEN X uan-yi , ZHANG Dan-yang. Study of gene polymorphism of Vibrio parahaemolyticus based on enterobacterial repetitive intergenic consensus sequences[J]. Chinese Journal of Microbiology and Immunology, 2012, 32(1)
Authors:SONG Qi-fa    XU Jing-ye    ZHU Guo-liang    SHEN X uan-yi    ZHANG Dan-yang
Abstract:
Keywords:Vibrio parahaemolyticus  Bacterial typing techniques  Enterobacterial repetitive intergenic consensus
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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