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基于生物信息学方法鉴定艾滋病抗病毒治疗病毒学失败的关键基因
引用本文:任博,沈从乐,李娟,马建和,方茜,李韦杰,王雅杰.基于生物信息学方法鉴定艾滋病抗病毒治疗病毒学失败的关键基因[J].标记免疫分析与临床,2021,28(10):1635-1639,1669.
作者姓名:任博  沈从乐  李娟  马建和  方茜  李韦杰  王雅杰
作者单位:首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京 100015
摘    要:目的 探究HIV感染者接受高效抗逆转录病毒治疗失败后的外周血单核细胞基因表达差异和信号通路的表达情况.方法 从GEO数据库中下载了数据集GSE52900,进行差异化基因的筛选,并通过GO、KEGG和PPI等网络分析确定关键基因和重要生物学通路.结果 从高效抗病毒治疗失败的外周血单核细胞基因表达谱中按照P<0.05和|log2(FC)|>1筛选出79个表达差异化基因,包括55个表达上调基因和24个表达下调基因.PPI网络鉴定出5个关键基因:CD4、CCL5、CXCR4、ITGAL、C1 QB.结论 GO和KEGG分析发现差异化基因主要富集在免疫应答通路,提示免疫因素在抗病毒治疗中发挥了重要作用.

关 键 词:艾滋病  抗病毒治疗  病毒学失败  差异表达基因

Identification of Key Genes for Virological Failure in AIDS Antiviral Therapy Based on Bioinformatics Methods
REN Bo,SHEN Congle,LI Juan,MA Jianhe,FANG Qian,LI Weijie,WANG Yajie.Identification of Key Genes for Virological Failure in AIDS Antiviral Therapy Based on Bioinformatics Methods[J].Labeled Immunoassays and Clinical Medicine,2021,28(10):1635-1639,1669.
Authors:REN Bo  SHEN Congle  LI Juan  MA Jianhe  FANG Qian  LI Weijie  WANG Yajie
Abstract:
Keywords:
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