用变性高效液相色谱检测CpG岛胞嘧啶甲基化

目的 :建立一种新型的CpG岛胞嘧啶甲基化快速检测方法。方法 :用亚硫酸氢钠处理DNA ,再用链特异性聚合酶链式反应 (PCR)对错配修复基因hMLH1启动子含CpG位点的靶序列进行扩增 ;利用变性高效液相色谱 (DHPLC)在部分变性温度下测定靶序列的保留时间 ,并与亚硫酸氢钠 酶切法测定结果进行比较。结果 :用DHPLC对结肠癌细胞株RKO和胃癌细胞株PACM 82的hMLH1启动子进行测定 ,发现RKO细胞PCR产物的保留时间明显长于PACM82细胞 (6 .7min比 6 .2min)。RKO细胞PCR产物保留时间延长是亚硫酸氢钠处理后的模板中胞嘧啶和岛嘌呤含量较PACM 82高所致。从此结果分析 ,可以判断出RKO的hMLH1启动子已甲基化 ,而PACM82细胞未甲基化。此结论与酶切法结果完全一致。结论 :新方法可以快速检测CpG岛胞嘧啶甲基化。