摘 要: | 目的探讨微RNA(miRNA)-129-1在结肠癌中的表达、调控、潜在作用机制和临床意义。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库中结肠癌的甲基化、mRNA表达和miRNA表达数据, 分析miRNA-129-1表达和甲基化的变化。利用miRwalk 2.0和TargetScan数据库联合预测miRNA-129-1靶基因, 采用DAVID 6.7在线软件对靶基因进行基因本体和京都基因与基因组百科全书富集分析, 利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 并再次利用TCGA数据库对miRNA-129-1的关键靶基因进行表达差异分析和预后分析。统计学方法采用配对t检验、独立样本t检验, 通过受试者操作特征曲线(ROC)评估miRNA-129-1甲基化对结肠癌的诊断价值, 采用Kaplan-Meier法和log-rank检验分析miRNA-129-1表达对患者生存的影响。结果 miRNA-129-1在各物种之间序列保守。对TCGA数据库所有结肠癌肿瘤样本和对照样本进行分析, 结果显示肿瘤样本中miRNA-129-1的表达与对照样本比较降低(0.98±0.81比5.74±0.59...
|