基于活性位点模型确定芬太尼类似物与人阿片u受体结构活性的关系 |
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引用本文: | 刘明,刘小利,万平,吴强三,胡文祥.基于活性位点模型确定芬太尼类似物与人阿片u受体结构活性的关系[J].中国神经再生研究,2011,6(4):267-276. |
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作者姓名: | 刘明 刘小利 万平 吴强三 胡文祥 |
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作者单位: | 首都师范大学生命科学学院,首都师范大学物理有机与药物化学研究所,Department of Chemistry, Capital Normal University, Beijing 100048, China,College of Life Science, Capital Normal University, Beijing 100048, China,Department of Chemistry, Capital Normal University, Beijing 100048, China,首都师范大学物理有机与药物化学研究所 |
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摘 要: | 成出高选择性、具有特殊药理特性的阿片μ受体激动剂—芬太尼类化合物,是一项具有挑战性的任务。我们采用同源模建的方法构建了人阿片μ受体的三维结构模型,对三种阿片μ受体蛋白序列做了同源性比对,并预测了二级结构。模型的可靠性经Ramachandran图和ProTable分析验证,并做了疏水性分析。验证了用CoMFA模型预测的可靠性,运用Surflex-Dock程序将一系列芬太尼类化合物对接到阿片μ受体。Biopolymer/SiteID计算结果表明,在跨膜区段TM 3, TM 5, TM 6 and TM 7结构域膜外侧有较深的结合空腔,同源模建方法预测人阿片μ-受体蛋白结构可能存在5个区域。重要的功能性氨基酸有TM3的Asp147, Tyr148, Tyr149 , TM6的Trp293, His297 , 和TM7的Trp318, His319, Ile322, Tyr326。同时预测了芬太尼哌啶环最优对接取向位置和芬太尼N-基团的结合位点取向位置,用分子动力学模拟研究探讨了配体构象和芬太尼取代基之间潜在的关系。我们的研究中更好地了解芬太尼类化合物和阿片μ受体的结构活性关系并阐述其作用机制,希望对合成无副作用的高效镇痛药物有指导意义。
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关 键 词: | 阿片μ受体 芬太尼类似物 激动剂 活性位点 结构活性关系 |
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