| 结肠癌APC2基因表达及预后的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 胡明超,王强,吴嘉旭,俞文渊. 结肠癌APC2基因表达及预后的生物信息学分析[J]. 临床检验杂志, 2021, 0(12): 941-944 |
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| 作者姓名： | 胡明超 王强 吴嘉旭 俞文渊 |
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| 作者单位： | 南京医科大学附属江苏盛泽医院 |
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| 基金项目： | ]：苏州市民生科技关键技术(SYSD202088)；苏州市临床医学专家团队引进项目(SZYJTD201726)；苏州市吴江区科教兴卫项目(wwk202009) |
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| 摘 要： | 目的：基于癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库分析APC2基因的表达水平在结肠癌患者中的诊断及预后价值。方法：从TCGA数据库中下载所有结肠腺癌(colon adenocarcinoma,COAD)病例APC2基因的RNA-Seq转录组数据以及对应的每个患者的临床参数,分析APC2基因的表达水平和结肠癌临床病理特征以及预后的关系,并利用String在线分析工具寻找与APC2相互作用的蛋白网络。结果：APC2在COAD组织中的表达量低于41例癌旁正常组织中APC2的表达量(0.87±0.42 vs 1.11±0.22, P<0.05)；受试者曲线显示APC2基因对COAD有较好的诊断价值(AUC=0.7391,95%CI=0.6855~0.7926,P<0.0001)；APC2基因的表达与COAD的淋巴结转移、TNM分期以及最终生存结局密切相关(P<0.05)；APC2低表达的COAD患者总体生存时间长于APC2高表达的患者(P<0.05)；CDC16,CDC23,CDC27,ANAPC15与APC2的作用密切相关。结论：APC2基因在COAD组织中呈表达下调,并与疾病的进展以及预后密切相关,有潜力成为结肠癌诊断、预后评估以及靶向治疗的新型生物学标志物。
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| 关 键 词： | 结肠癌；腺瘤性结肠息肉病基因 ２；生物信息学；预后 |
| 收稿时间： | 2021-03-18 |
Bioinformatics analysis of APC2 gene expression and prognosis of colon cancerHu mingchao, Wang qiang, Wu jia xu, Yu wenyuan* |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Key words: colon cancer adenomatous polyposis coli2 gene bioinformatics prognosis |
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