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我国仙茅属植物遗传关系的RAPD分析
引用本文:李隆云,陈大霞,钟国跃,李泉森.我国仙茅属植物遗传关系的RAPD分析[J].医学教育探索,2011,42(5):980-984.
作者姓名:李隆云  陈大霞  钟国跃  李泉森
作者单位:重庆市中药研究院中药种植研究所, 重庆市中药良种选育与评价工程技术研究中心, 重庆 400065
基金项目:国家科技攻关计划项目(2001BA701A32,2004BA604A04);重庆市科技计划项目(6455)
摘    要:目的 从分子水平研究我国仙茅属(Curculigo Gaertn.)植物的遗传关系。方法 对我国仙茅属植物7个国产种30个单株进行RAPD分析。运用Popgene Version1.31软件计算相关参数,采用UPGMA聚类法进行聚类分析。结果 11个RAPD引物共扩增出157条带,其中有145条呈多态性。我国仙茅属植物的遗传多样性极为丰富,在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为92.36%,平均每个位点的有效等位基因数(Ne)为1.493 7, Nei’s基因多样性指数(H)为0.300 1,Shannon’s多样性信息指数Hsp为0.457 7。在种内水平上,PPB=5.09%,Ne=1.036 6,H=0.020 4,种内Shannon’s多样性信息指数(Hpop)为0.029 8。Nei’s 基因多样性指数计算的种间遗传分化系数(Gst=0.931 3)与Shannon’s分化系数(0.934 9)基本一致,均说明大部分遗传变异存在于种间。种间基因流(Nm)为0.036 9,说明种间基因流动较少,遗传分化程度较高。两种间的Nei’s遗传一致度(I)的范围为0.520 8~0.823 7。根据Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类,基于RAPD分子标记的聚类结果与传统分类一致。结论 我国仙茅属植物的遗传多样性十分丰富,且种间的遗传差异大于种内的遗传差异。

关 键 词:仙茅属  随机扩增多态性DNA  遗传多样性  聚类分析  多态性条带

Analysis on genetic relationship of plants in Curculigo Gaertn. from China by RAPD
LI Long-yun,CHEN Da-xi,ZHONG Guo-yue,LI Quan-sen.Analysis on genetic relationship of plants in Curculigo Gaertn. from China by RAPD[J].Researches in Medical Education,2011,42(5):980-984.
Authors:LI Long-yun  CHEN Da-xi  ZHONG Guo-yue  LI Quan-sen
Institution:Chongqing Engineering Research Center for Fine Variety Breeding Techniques of Chinese Materia Medica, Institute of Chinese Materia Medica Planting, Chongqing Academy of Chinese Materia Medica, Chongqing 400065, China
Abstract:
Keywords:Curculigo Gaertn    random amplified polymorphic DNA (RAPD)  genetic diversity  clustering analysis  polymorphic bands
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