某巡逻船聚集性诺如病毒疫情的病原基因特征分析 |
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引用本文: | 舒纪为,管临福,张彤杰,任宜,叶凌,徐妮,王蓉,黄懋雯.某巡逻船聚集性诺如病毒疫情的病原基因特征分析[J].上海预防医学,2022,34(11):1112-1117. |
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作者姓名: | 舒纪为 管临福 张彤杰 任宜 叶凌 徐妮 王蓉 黄懋雯 |
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作者单位: | 1.岱山县疾病预防控制中心,浙江 舟山 316299 |
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基金项目: | 浙江省宁波市医学科技计划项目(2019Y30);岱山县一般科技项目(201913) |
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摘 要: | 目的对浙江省岱山县2022年2月一起罕见的重组型诺如病毒暴发疫情进行病原学鉴定及基因分子特征分析。方法采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)法对送检的8份肛拭样本进行诺如病毒病原学鉴定,用普通逆转录PCR(RT?PCR)对阳性样本基因扩增,用MEGA7.0及Simplot软件对扩增序列进行基因特征分析。结果送检的8份标本鉴定结果均为诺如病毒GⅠ型,基因特征分析为重组诺如病毒GⅠ.6[P11]亚型,重组位点位于ORF1?ORF2连接处。同源性最高(98.75%)的是2018年登录的GⅠ.6[P11]毒株序列(登录号:MT357995)。结论经病原学鉴定与基因特征分析,本次暴发疫情是由罕见重组型诺如病毒GⅠ.6[P11]亚型引起。
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关 键 词: | 重组 GⅠ.6[P11] 病原学鉴定 基因分型 |
收稿时间: | 2022-03-09 |
Etiological identification and phylogenetic analysis of a clustered epidemic caused by norovirus on a patrol boat |
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