乙型肝炎病毒相关肝细胞癌核心差异表达基因生物信息学分析

目的 探索与乙型肝炎病毒（HBV）相关肝细胞癌（HCC）发生发展相关的核心基因，为进一步揭示HBV相关HCC发病机制提供参考。方法 从高通量基因表达数据库（GEO）中下载GSE55092、GSE121248两个数据集，采用R语言筛选HCC组织和癌旁组织间差异表达基因（DEGs），并绘制可视化火山图。对DEGs基因进行基因本体论（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析，构建蛋白质相互作用（PPI）网络，并用Cytoscape 3.9.0开源平台中分子复合物检测（MCODE）和cytoHubba插件筛选核心DEGs。利用UALCAN和Kaplan Meier-plotter数据库中临床样本数据对筛选出的核心DEGs进行差异表达和生存分析验证。结果 从GSE55092数据集和GSE121248数据集中分别筛选出1 148个和686个DEGs，其中下调表达基因分别为703个和477个、上调表达基因分别为445个和209个；两个数据集共筛选出557个共同表达的DEGs，其中下调表达基因384个、上调表达基因173个。GO富集分析显示，DEGs主要参与细胞分裂、细胞增殖、氧化还原、免...