基于抗体的特发性炎性肌病患者外周血基因表达谱分析题录 |
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引用本文: | 李牧原,王莉,李全贞,罗卉,张华莉.基于抗体的特发性炎性肌病患者外周血基因表达谱分析题录[J].中华风湿病学杂志,2024(1). |
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作者姓名: | 李牧原 王莉 李全贞 罗卉 张华莉 |
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作者单位: | 1. 中南大学湘雅医院风湿免疫科;2. 中南大学基础医学院病理生理学系 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(82070018); |
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摘 要: | 目的通过对抗黑色素瘤分化相关基因5(MDA5)抗体阳性和抗Jo-1抗体阳性的肌炎患者外周血单个核细胞(PBMCs)进行基因表达谱的分析, 以阐明特发性炎性肌病亚型的病理生理学机制。方法①用Illumina HT-12 v4表达谱芯片对12例抗MDA5抗体阳性和16例抗Jo-1抗体阳性的肌炎患者及43名健康对照者的PBMCs进行基因表达谱筛查和分析。应用非配对t检验, 经Benjamini-Hochberg校正, 选取基因表达信号倍数变化的绝对值≥2且校正P<0.05为差异表达基因。将差异基因集进行基因本体论数据库(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析, 以P<0.05作为显著性富集的阈值。②用实时荧光聚合酶链反应(real time-PCR)对差异表达基因进行验证, 采用Kolmogorov-Smirnov检验对连续型变量进行正态性检验, 符合正态分布且方差齐性, 采用单因素方差分析, 不符合正态分布则用Kruskal-Wallis检验, P<0.05为差异有统计学意义。结果①分析抗MDA5抗体和抗Jo-1抗体阳性患者PBMCs的基因表...
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关 键 词: | 肌炎 自身抗体 基因表达谱 芯片分析技术 干扰素刺激基因 RIG-Ⅰ样受体 |
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