基于TCGA数据库分析SCAMP3在肝细胞癌的表达及预后情况题录

目的分析载体膜蛋白3(SCAMP3)在肝细胞癌中的表达和对预后的影响以及基因集富集分析。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析SCAMP3表达和预后。收集2021年1月期间丽水市中心医院4例肝细胞癌患者的癌组织及癌旁组织检测SCAMP3的表达。基于TCGA数据, 单因素和多因素Cox回归分析SCAMP3表示与肝细胞癌患者预后关系。利用基因集富集分析探索SCAMP3的生物学作用。结果 TCGA数据库中, 肝细胞癌组织中SCAMP3表达高于正常肝组织, 差异有统计学意义(Z=-8.38, P<0.001)。基于SCAMP3表达的中位数将患者分为低表达组(n=185)和高表达组(n=185), SCAMP3高表达患者总体生存率更低。手术切除的4例肝细胞癌患者癌组织和癌旁组织, 癌组织中SCAMP3 mRNA、蛋白相对表达均高于癌旁组织, 差异均有统计学意义(t=8.55、6.24, 均P<0.001)。多因素Cox回归分析, SCAMP3表达越高, 死亡风险越高(HR=1.466, 95%CI:1.143～1.881, P<0.001)。基因集富集分析在SCAMP3高...