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基于KEGG通路富集分析颗粒酶B-穿孔素选择性诱导胰腺炎时巨噬细胞凋亡的作用
引用本文:孔鸿儒,俞浩辉,陈格尔,陈咨苗,戴胜杰,孙学成,金约朋,杨文军,孙洪伟. 基于KEGG通路富集分析颗粒酶B-穿孔素选择性诱导胰腺炎时巨噬细胞凋亡的作用[J]. 温州医科大学学报, 2022, 52(12): 972-980. DOI: 10.3969/j.issn.2095-9400.2022.12.004
作者姓名:孔鸿儒  俞浩辉  陈格尔  陈咨苗  戴胜杰  孙学成  金约朋  杨文军  孙洪伟
作者单位:1.温州医科大学附属第一医院 肝胆胰外科,浙江 温州 325015;2.温州医科大学 第一临床医学院(信息与工程学院),浙江 温州 325035;3.温州医科大学附属第一医院 内分泌科,浙江 温州 325015;4.温州医科大学附属第一医院 消化内科,浙江 温州 325015
基金项目:温州市基础性科研项目(Y20180077,Y20180103)。
摘    要:目的:从分子水平探究颗粒酶B(GRB)-穿孔素(PFP)对选择性诱导胰腺炎时巨噬细胞凋亡的影响。方法:采用肿瘤坏死因子α(TNF-α)刺激人单核巨噬细胞系(TPH-1)模拟急性胰腺炎时巨噬细胞炎症反应,通过CCK8法筛选TNF-α、PFP、GRB的最适浓度;流式细胞仪分别检测对照组、TNF-α组、PFP+GRB组、TNF-α+PFP+GRB组的细胞凋亡情况。将细胞样本分为3组:正常细胞组(NC组)、TNF-α处理组(Treat1组)和TNF-α+PFP+GRB处理组(Treat2组)。提取3组细胞RNA进行转录组学分析,分别通过主成分分析、差异基因分析、富集分析检测各组基因表达情况;选取“细胞因子-细胞因子受体相互作用通路”中的7 个差异表达基因(RAB37、GPA33、USH1C、SYTL1、MSRB3、GPER1 和CD1B)应用荧光定量PCR验证转录组学分析的准确性。结果:Treat2组与Treat1及NC组相比,细胞凋亡比例显著升高(P <0.05);NC组与Treat1组、Treat2组的差异比较大,显著差异基因较多,而Treat1组与Treat2组的显著差异基因较少,但Treat2组比Treat1组相对于NC组的变化更大;富集分析显示差异基因主要富集于“细胞因子-细胞因子受体相互作用通路”;荧光定量PCR结果显示,所选取的7个差异基因与NC组相比明显下调(P <0.05),和转录组学结果趋势一致。结论:GRB-PFP可选择性诱导胰腺炎时巨噬细胞的凋亡,并作用于“细胞因子-细胞因子受体相互作用通路”,从而下调细胞因子表达,减轻炎症反应。

关 键 词:胰腺炎  细胞凋亡  细胞因子  巨噬细胞  颗粒酶B  穿孔素  
收稿时间:2022-07-12

The role of granzyme B-perforin in selectively inducing apoptosis of macrophages in pancreatitis based on KEGG pathway enrichment analysis
KONG Hongru,YU Haohui,CHEN Geer,CHEN Zimiao,DAI Shengjie,SUN Xuecheng,JIN Yuepeng,YANG Wenjun,SUN Hongwei. The role of granzyme B-perforin in selectively inducing apoptosis of macrophages in pancreatitis based on KEGG pathway enrichment analysis[J]. JOURNAL OF WENZHOU MEDICAL UNIVERSITY, 2022, 52(12): 972-980. DOI: 10.3969/j.issn.2095-9400.2022.12.004
Authors:KONG Hongru  YU Haohui  CHEN Geer  CHEN Zimiao  DAI Shengjie  SUN Xuecheng  JIN Yuepeng  YANG Wenjun  SUN Hongwei
Affiliation:1.Department of Hepatopancreatobiliary Surgery, the First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou 325015,China; 2.The First School of Medicine, School of Information and Engineering, Wenzhou Medical University,Wenzhou 325035, China; 3.Department of Endocrinology, the First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou 325015, China; 4.Department of Gastroenterology, the First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou 325015, China
Abstract:
Keywords:pancreatitis  cell apoptosis  cytokines  pancreatic acinar cell  granzyme B  perforin  
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