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LAMA3在泛癌中的表达水平及其与泛癌预后、免疫微环境的相关性分析
引用本文:张梦杰,刘俊丽,杨娜,杨玲,韩继明. LAMA3在泛癌中的表达水平及其与泛癌预后、免疫微环境的相关性分析[J]. 延安大学学报(医学科学版), 2022, 20(4): 6-11
作者姓名:张梦杰  刘俊丽  杨娜  杨玲  韩继明
作者单位:1.延安大学医学院, 陕西 延安 716000;2.空军军医大学生物化学与分子生物学教研室, 陕西 西安 710032
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81760510)
摘    要:目的 分析层粘连蛋白3(Laminin subunit alpha 3,LAMA3)在泛癌中的表达水平及其与泛癌患者预后、免疫微环境之间的关系。方法 本研究从多个数据库中收集转录组、预后、免疫相关数据,可视化分析LAMA3在泛癌中的表达水平及其与泛癌预后、免疫微环境的相关性。结果 与正常组织相比,LAMA3在11种肿瘤中显著高表达,如结肠癌(colon adenocarcinoma,COAD),肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC),胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)等;在11种肿瘤中显著低表达,如胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme, GBM)、脑低级别胶质瘤(brain lower grade glioma,LGG)、皮肤黑色素瘤(skin cutaneous melanoma,SKCM)等。LAMA3表达水平不仅与包括PAAD在内的多种肿瘤预后显著相关,还与SKCM等多种肿瘤的肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)、微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)和肿瘤免疫浸润显著相关。此外,基因共表达分析结果表明LAMA3与多种常见的免疫基因表达显著相关。结论 LAMA3可作为泛癌预后、免疫治疗反应评估的生物标志物。

关 键 词:层粘连蛋白3  泛癌  预后  免疫微环境  
收稿时间:2022-06-06

The expression level of LAMA3 in pan-cancer and its correlation with pan-cancer prognosis and immune microenvironment
ZHANG Mengjie,LIU Junli,YANG Na,YANG Ling,HAN Jiming. The expression level of LAMA3 in pan-cancer and its correlation with pan-cancer prognosis and immune microenvironment[J]. Journal of Yanan University:Medical Science Edition, 2022, 20(4): 6-11
Authors:ZHANG Mengjie  LIU Junli  YANG Na  YANG Ling  HAN Jiming
Affiliation:1. Medical College of Yan'an University, Yan'an 716000, China; 2. Department of Biochemistry and Molecular Biology, Air Force Military Medical University, Xi'an 710032, China
Abstract:
Keywords:LAMA3  Pan-cancer  Prognostic  Immune microenvironment  
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