mmu-mir-221/222/500及其靶基因在叶酸缺乏小鼠神经管畸形中相关性的研究

目的寻找叶酸缺乏相关的神经管畸形(NTDs)候选miRNAs及其靶基因。方法在前期NTDs叶酸缺乏动物模型基础上,对已发现的3个高置信度基因组拷贝数变异(CNVs)和小鼠miRNAs基因组位置比对得到CNV覆盖下相应的miRNAs;与已建立的人类和小鼠NTD相关基因数据库比对,应用系统生物信息学分析筛选出NTDs候选miRNAs及其靶基因;并用q PCR验证miRNAs及候选靶基因。结果与已知小鼠miRNAs基因组位置比对发现8个miRNAs;进一步生物信息学分析发现,有3个NTD候选miRNAs(mmu-mir-221,mmu-mir-222,mmu-mir-500)及其12个候选靶基因;q PCR结果显示,与正常胚胎神经组织相比,NTD胚胎神经组织中9个候选基因表达显著下调(P0.05),但在其亲代组织及胚胎其他组织中并未发现下调。结论 3个miRNAs及其9个候选靶基因与叶酸缺乏NTDs的发生密切相关。