| 基于16S rRNA测序对树鼩肠道菌群特征与高级别肉瘤的相关性分析 |
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| 引用本文： | 黄鑫,古文鹏,黎晓慧,李娜,贾杰,李明学,代解杰.基于16S rRNA测序对树鼩肠道菌群特征与高级别肉瘤的相关性分析[J].中国比较医学杂志,2019(8):11-16,49. |
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| 作者姓名： | 黄鑫 古文鹏 黎晓慧 李娜 贾杰 李明学 代解杰 |
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| 作者单位： | 昆明医科大学;中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所树鼩种质资源中心 |
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| 基金项目： | 云南省科技人才和平台计划项目(2017HC019);云南省联合支持国家计划项目(2015GA009);云南省重大科技专项(2017ZF007) |
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| 摘 要： | 目的检测高级别肉瘤的树鼩肠道微生物菌群结构,为探讨肠道微生物菌群结构的改变与肿瘤发生的相关性提供科学依据。方法选取3例患有恶性高级别肉瘤树鼩粪便为CA组,6例健康树鼩粪便为对照NO组。通过16SV3+4区引物进行细菌多样性的鉴定,通过对Reads剪切过滤,OTUs聚类,并进行物种注释及丰度分析,得出两组树鼩肠道微生物结构、丰度以及多样性。结果比较CA组和NO组树鼩肠道微生物结构,多样性指数Chao1指数值、ACE指数值、Shannon指数值差异无统计学意义(P>0.05)。NO组的树鼩肠道菌群OTUs为640种,而CA组为494种,健康树鼩肠道菌群结构呈多样性。在门水平上比较,其中CA组中螺旋体门(Spirochaetes)丰度为0.03%,低于NO组(丰度为0.12%),且差异有统计学意义(P<0.05);CA组厚壁菌门(Firmicutes)丰度为77.79%高于NO组(47.65%),但差异无统计学意义;CA组的拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度为0.75%低于NO组(8.31%),但差异无统计学意义。CA组中的乳杆菌属(lactobacillus)是具有统计学意义的生物标识。结论患有高级别肉瘤树鼩的肠道菌群结构丰度和多样性低于健康树鼩,肠道菌群的结构改变及厚壁菌门含量增加可能增加恶性肿瘤的发生。
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| 关 键 词： | 肠道菌群 高级别肉瘤 16srRNA测序 树鼩 |
Correlation analysis of intestinal tract microflora dysregulation and high-grade sarcoma based on 16S rRNA sequencing |
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| HUANG Xin,GU Wenpeng,LI Xiaohui,LI Na,JIA Jie,LI Mingxue,DAI Jiejie.Correlation analysis of intestinal tract microflora dysregulation and high-grade sarcoma based on 16S rRNA sequencing[J].Chinese Journal of Comparative Medicine,2019(8):11-16,49. |
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| Authors: | HUANG Xin GU Wenpeng LI Xiaohui LI Na JIA Jie LI Mingxue DAI Jiejie |
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| Institution: | (Kunming Medical University,Kunming 650500,China;Chinese Academy of Medical Sciences/Peking UnionMedical College,Institute of Medical Biology,Center of Tree Shrews Germplasm Resource,Yunnan Key Laboratory ofMajor Infections Diseases Vaccine Development,Kunming 650118) |
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| Abstract: | HUANG Xin;GU Wenpeng;LI Xiaohui;LI Na;JIA Jie;LI Mingxue;DAI Jiejie(Kunming Medical University,Kunming 650500,China;Chinese Academy of Medical Sciences/Peking UnionMedical College,Institute of Medical Biology,Center of Tree Shrews Germplasm Resource,Yunnan Key Laboratory ofMajor Infections Diseases Vaccine Development,Kunming 650118) |
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| Keywords: | intestinal microflora high-grade sarcoma 16S rRNA sequence tree shrews |
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